Protein–RNA interactions for Protein: O43283

MAP3K13, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 13, humanhuman

Predictions only

Length 966 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K13O43283 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MAP3K13O43283 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MAP3K13O43283 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MAP3K13O43283 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MAP3K13O43283 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MAP3K13O43283 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
MAP3K13O43283 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MAP3K13O43283 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
MAP3K13O43283 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MAP3K13O43283 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MAP3K13O43283 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
MAP3K13O43283 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MAP3K13O43283 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MAP3K13O43283 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MAP3K13O43283 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
MAP3K13O43283 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MAP3K13O43283 LINC01551-203ENST00000550266 455 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
MAP3K13O43283 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MAP3K13O43283 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MAP3K13O43283 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MAP3K13O43283 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MAP3K13O43283 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MAP3K13O43283 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MAP3K13O43283 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MAP3K13O43283 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MAP3K13O43283 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MAP3K13O43283 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MAP3K13O43283 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MAP3K13O43283 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MAP3K13O43283 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MAP3K13O43283 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.27■■□□□ 1
MAP3K13O43283 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC21.27■■□□□ 1
MAP3K13O43283 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MAP3K13O43283 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MAP3K13O43283 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
MAP3K13O43283 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MAP3K13O43283 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MAP3K13O43283 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
MAP3K13O43283 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
MAP3K13O43283 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MAP3K13O43283 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MAP3K13O43283 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MAP3K13O43283 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MAP3K13O43283 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MAP3K13O43283 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MAP3K13O43283 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MAP3K13O43283 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MAP3K13O43283 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MAP3K13O43283 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MAP3K13O43283 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MAP3K13O43283 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
MAP3K13O43283 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
MAP3K13O43283 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MAP3K13O43283 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MAP3K13O43283 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MAP3K13O43283 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MAP3K13O43283 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MAP3K13O43283 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MAP3K13O43283 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MAP3K13O43283 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MAP3K13O43283 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MAP3K13O43283 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MAP3K13O43283 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MAP3K13O43283 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MAP3K13O43283 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MAP3K13O43283 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MAP3K13O43283 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
MAP3K13O43283 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
MAP3K13O43283 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MAP3K13O43283 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MAP3K13O43283 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
MAP3K13O43283 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MAP3K13O43283 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
MAP3K13O43283 AL355338.1-201ENST00000612598 913 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MAP3K13O43283 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MAP3K13O43283 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MAP3K13O43283 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MAP3K13O43283 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MAP3K13O43283 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MAP3K13O43283 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MAP3K13O43283 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MAP3K13O43283 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MAP3K13O43283 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MAP3K13O43283 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MAP3K13O43283 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MAP3K13O43283 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MAP3K13O43283 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MAP3K13O43283 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MAP3K13O43283 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MAP3K13O43283 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MAP3K13O43283 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MAP3K13O43283 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MAP3K13O43283 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MAP3K13O43283 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MAP3K13O43283 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MAP3K13O43283 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MAP3K13O43283 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MAP3K13O43283 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MAP3K13O43283 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MAP3K13O43283 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms