Protein–RNA interactions for Protein: O15061

SYNM, Synemin, humanhuman

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNMO15061 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
SYNMO15061 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
SYNMO15061 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
SYNMO15061 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
SYNMO15061 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
SYNMO15061 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
SYNMO15061 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
SYNMO15061 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
SYNMO15061 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
SYNMO15061 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
SYNMO15061 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
SYNMO15061 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
SYNMO15061 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
SYNMO15061 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
SYNMO15061 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
SYNMO15061 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
SYNMO15061 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
SYNMO15061 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
SYNMO15061 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
SYNMO15061 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
SYNMO15061 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
SYNMO15061 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
SYNMO15061 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
SYNMO15061 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
SYNMO15061 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
SYNMO15061 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
SYNMO15061 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
SYNMO15061 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
SYNMO15061 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
SYNMO15061 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
SYNMO15061 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
SYNMO15061 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
SYNMO15061 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
SYNMO15061 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
SYNMO15061 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
SYNMO15061 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
SYNMO15061 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
SYNMO15061 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
SYNMO15061 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
SYNMO15061 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
SYNMO15061 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
SYNMO15061 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
SYNMO15061 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
SYNMO15061 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
SYNMO15061 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
SYNMO15061 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
SYNMO15061 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
SYNMO15061 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
SYNMO15061 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
SYNMO15061 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
SYNMO15061 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
SYNMO15061 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
SYNMO15061 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC30.14■■■□□ 2.42
SYNMO15061 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
SYNMO15061 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
SYNMO15061 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
SYNMO15061 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
SYNMO15061 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
SYNMO15061 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
SYNMO15061 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
SYNMO15061 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
SYNMO15061 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
SYNMO15061 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
SYNMO15061 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.13■■■□□ 2.41
SYNMO15061 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
SYNMO15061 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
SYNMO15061 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
SYNMO15061 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
SYNMO15061 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
SYNMO15061 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
SYNMO15061 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
SYNMO15061 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
SYNMO15061 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
SYNMO15061 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
SYNMO15061 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
SYNMO15061 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
SYNMO15061 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
SYNMO15061 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
SYNMO15061 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
SYNMO15061 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
SYNMO15061 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
SYNMO15061 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
SYNMO15061 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
SYNMO15061 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
SYNMO15061 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
SYNMO15061 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
SYNMO15061 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
SYNMO15061 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
SYNMO15061 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
SYNMO15061 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
SYNMO15061 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
SYNMO15061 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
SYNMO15061 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
SYNMO15061 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
SYNMO15061 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
SYNMO15061 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
SYNMO15061 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
SYNMO15061 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
SYNMO15061 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
SYNMO15061 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms