Protein–RNA interactions for Protein: O00468

AGRN, Agrin, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGRNO00468 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AGRNO00468 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AGRNO00468 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AGRNO00468 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AGRNO00468 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AGRNO00468 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AGRNO00468 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AGRNO00468 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AGRNO00468 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AGRNO00468 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AGRNO00468 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AGRNO00468 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AGRNO00468 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AGRNO00468 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AGRNO00468 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AGRNO00468 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AGRNO00468 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AGRNO00468 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AGRNO00468 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
AGRNO00468 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AGRNO00468 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AGRNO00468 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AGRNO00468 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AGRNO00468 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AGRNO00468 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AGRNO00468 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AGRNO00468 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AGRNO00468 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AGRNO00468 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AGRNO00468 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
AGRNO00468 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AGRNO00468 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AGRNO00468 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AGRNO00468 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AGRNO00468 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AGRNO00468 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AGRNO00468 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AGRNO00468 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AGRNO00468 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AGRNO00468 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AGRNO00468 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AGRNO00468 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AGRNO00468 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AGRNO00468 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AGRNO00468 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AGRNO00468 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AGRNO00468 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AGRNO00468 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AGRNO00468 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AGRNO00468 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AGRNO00468 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AGRNO00468 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AGRNO00468 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AGRNO00468 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
AGRNO00468 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AGRNO00468 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AGRNO00468 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AGRNO00468 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AGRNO00468 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
AGRNO00468 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AGRNO00468 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AGRNO00468 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AGRNO00468 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AGRNO00468 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AGRNO00468 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AGRNO00468 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AGRNO00468 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AGRNO00468 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AGRNO00468 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AGRNO00468 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AGRNO00468 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AGRNO00468 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AGRNO00468 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AGRNO00468 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AGRNO00468 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AGRNO00468 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AGRNO00468 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AGRNO00468 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AGRNO00468 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AGRNO00468 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AGRNO00468 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
AGRNO00468 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AGRNO00468 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AGRNO00468 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AGRNO00468 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AGRNO00468 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
AGRNO00468 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
AGRNO00468 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
AGRNO00468 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AGRNO00468 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AGRNO00468 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AGRNO00468 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AGRNO00468 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AGRNO00468 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AGRNO00468 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AGRNO00468 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AGRNO00468 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AGRNO00468 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AGRNO00468 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AGRNO00468 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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