Protein–RNA interactions for Protein: O00329

PIK3CD, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit delta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CDO00329 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PIK3CDO00329 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PIK3CDO00329 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PIK3CDO00329 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PIK3CDO00329 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PIK3CDO00329 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PIK3CDO00329 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PIK3CDO00329 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PIK3CDO00329 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PIK3CDO00329 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PIK3CDO00329 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PIK3CDO00329 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PIK3CDO00329 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PIK3CDO00329 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PIK3CDO00329 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PIK3CDO00329 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PIK3CDO00329 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PIK3CDO00329 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PIK3CDO00329 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PIK3CDO00329 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PIK3CDO00329 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PIK3CDO00329 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PIK3CDO00329 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PIK3CDO00329 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PIK3CDO00329 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PIK3CDO00329 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PIK3CDO00329 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PIK3CDO00329 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PIK3CDO00329 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PIK3CDO00329 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PIK3CDO00329 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PIK3CDO00329 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PIK3CDO00329 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PIK3CDO00329 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PIK3CDO00329 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PIK3CDO00329 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PIK3CDO00329 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PIK3CDO00329 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PIK3CDO00329 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PIK3CDO00329 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PIK3CDO00329 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PIK3CDO00329 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PIK3CDO00329 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PIK3CDO00329 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PIK3CDO00329 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PIK3CDO00329 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PIK3CDO00329 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PIK3CDO00329 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PIK3CDO00329 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PIK3CDO00329 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PIK3CDO00329 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PIK3CDO00329 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PIK3CDO00329 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PIK3CDO00329 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PIK3CDO00329 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PIK3CDO00329 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PIK3CDO00329 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PIK3CDO00329 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PIK3CDO00329 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PIK3CDO00329 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PIK3CDO00329 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PIK3CDO00329 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PIK3CDO00329 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PIK3CDO00329 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PIK3CDO00329 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PIK3CDO00329 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PIK3CDO00329 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PIK3CDO00329 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PIK3CDO00329 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PIK3CDO00329 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PIK3CDO00329 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PIK3CDO00329 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PIK3CDO00329 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PIK3CDO00329 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PIK3CDO00329 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PIK3CDO00329 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PIK3CDO00329 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PIK3CDO00329 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PIK3CDO00329 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PIK3CDO00329 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PIK3CDO00329 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PIK3CDO00329 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PIK3CDO00329 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PIK3CDO00329 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PIK3CDO00329 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PIK3CDO00329 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PIK3CDO00329 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PIK3CDO00329 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PIK3CDO00329 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PIK3CDO00329 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PIK3CDO00329 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PIK3CDO00329 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PIK3CDO00329 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PIK3CDO00329 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PIK3CDO00329 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PIK3CDO00329 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PIK3CDO00329 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PIK3CDO00329 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PIK3CDO00329 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PIK3CDO00329 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms