Protein–RNA interactions for Protein: O00294

TULP1, Tubby-related protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TULP1O00294 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TULP1O00294 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TULP1O00294 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TULP1O00294 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TULP1O00294 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TULP1O00294 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TULP1O00294 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TULP1O00294 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TULP1O00294 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
TULP1O00294 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TULP1O00294 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TULP1O00294 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TULP1O00294 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TULP1O00294 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TULP1O00294 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TULP1O00294 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TULP1O00294 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TULP1O00294 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TULP1O00294 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TULP1O00294 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TULP1O00294 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TULP1O00294 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TULP1O00294 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TULP1O00294 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TULP1O00294 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TULP1O00294 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TULP1O00294 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TULP1O00294 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TULP1O00294 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TULP1O00294 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TULP1O00294 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TULP1O00294 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TULP1O00294 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TULP1O00294 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TULP1O00294 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TULP1O00294 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TULP1O00294 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TULP1O00294 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TULP1O00294 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TULP1O00294 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TULP1O00294 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TULP1O00294 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TULP1O00294 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TULP1O00294 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TULP1O00294 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TULP1O00294 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TULP1O00294 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TULP1O00294 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TULP1O00294 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TULP1O00294 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TULP1O00294 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TULP1O00294 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TULP1O00294 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TULP1O00294 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TULP1O00294 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TULP1O00294 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TULP1O00294 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TULP1O00294 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TULP1O00294 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TULP1O00294 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TULP1O00294 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TULP1O00294 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TULP1O00294 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TULP1O00294 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TULP1O00294 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TULP1O00294 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TULP1O00294 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TULP1O00294 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TULP1O00294 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TULP1O00294 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TULP1O00294 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TULP1O00294 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TULP1O00294 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TULP1O00294 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TULP1O00294 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TULP1O00294 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TULP1O00294 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TULP1O00294 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TULP1O00294 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TULP1O00294 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TULP1O00294 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TULP1O00294 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TULP1O00294 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TULP1O00294 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TULP1O00294 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TULP1O00294 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TULP1O00294 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
TULP1O00294 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TULP1O00294 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TULP1O00294 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TULP1O00294 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
TULP1O00294 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TULP1O00294 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TULP1O00294 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TULP1O00294 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TULP1O00294 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TULP1O00294 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
TULP1O00294 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TULP1O00294 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TULP1O00294 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.7 ms