Protein–RNA interactions for Protein: O00291

HIP1, Huntingtin-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,037 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIP1O00291 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
HIP1O00291 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
HIP1O00291 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
HIP1O00291 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
HIP1O00291 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HIP1O00291 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HIP1O00291 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HIP1O00291 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
HIP1O00291 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HIP1O00291 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HIP1O00291 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HIP1O00291 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HIP1O00291 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HIP1O00291 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HIP1O00291 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HIP1O00291 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HIP1O00291 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
HIP1O00291 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HIP1O00291 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HIP1O00291 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HIP1O00291 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HIP1O00291 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HIP1O00291 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HIP1O00291 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HIP1O00291 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HIP1O00291 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HIP1O00291 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HIP1O00291 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
HIP1O00291 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HIP1O00291 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HIP1O00291 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HIP1O00291 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HIP1O00291 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HIP1O00291 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HIP1O00291 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HIP1O00291 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HIP1O00291 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HIP1O00291 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HIP1O00291 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HIP1O00291 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HIP1O00291 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HIP1O00291 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HIP1O00291 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HIP1O00291 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
HIP1O00291 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HIP1O00291 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HIP1O00291 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
HIP1O00291 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HIP1O00291 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HIP1O00291 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HIP1O00291 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HIP1O00291 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HIP1O00291 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HIP1O00291 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HIP1O00291 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HIP1O00291 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HIP1O00291 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HIP1O00291 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HIP1O00291 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HIP1O00291 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HIP1O00291 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HIP1O00291 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HIP1O00291 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
HIP1O00291 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
HIP1O00291 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
HIP1O00291 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
HIP1O00291 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
HIP1O00291 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HIP1O00291 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HIP1O00291 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HIP1O00291 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
HIP1O00291 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
HIP1O00291 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HIP1O00291 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HIP1O00291 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HIP1O00291 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HIP1O00291 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HIP1O00291 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HIP1O00291 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HIP1O00291 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HIP1O00291 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HIP1O00291 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HIP1O00291 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HIP1O00291 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HIP1O00291 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HIP1O00291 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HIP1O00291 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HIP1O00291 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HIP1O00291 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HIP1O00291 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HIP1O00291 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HIP1O00291 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
HIP1O00291 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HIP1O00291 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HIP1O00291 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HIP1O00291 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HIP1O00291 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HIP1O00291 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HIP1O00291 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HIP1O00291 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms