Protein–RNA interactions for Protein: O00116

AGPS, Alkyldihydroxyacetonephosphate synthase, peroxisomal, humanhuman

Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGPSO00116 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AGPSO00116 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
AGPSO00116 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AGPSO00116 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
AGPSO00116 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AGPSO00116 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AGPSO00116 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AGPSO00116 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AGPSO00116 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
AGPSO00116 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AGPSO00116 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AGPSO00116 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AGPSO00116 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AGPSO00116 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AGPSO00116 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
AGPSO00116 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AGPSO00116 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AGPSO00116 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
AGPSO00116 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
AGPSO00116 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AGPSO00116 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
AGPSO00116 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
AGPSO00116 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AGPSO00116 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AGPSO00116 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
AGPSO00116 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
AGPSO00116 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
AGPSO00116 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AGPSO00116 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AGPSO00116 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AGPSO00116 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
AGPSO00116 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AGPSO00116 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AGPSO00116 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
AGPSO00116 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AGPSO00116 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AGPSO00116 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
AGPSO00116 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AGPSO00116 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AGPSO00116 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AGPSO00116 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
AGPSO00116 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
AGPSO00116 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AGPSO00116 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AGPSO00116 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AGPSO00116 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AGPSO00116 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
AGPSO00116 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
AGPSO00116 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
AGPSO00116 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
AGPSO00116 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
AGPSO00116 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
AGPSO00116 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
AGPSO00116 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AGPSO00116 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AGPSO00116 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AGPSO00116 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
AGPSO00116 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
AGPSO00116 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AGPSO00116 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
AGPSO00116 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AGPSO00116 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
AGPSO00116 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
AGPSO00116 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
AGPSO00116 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AGPSO00116 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AGPSO00116 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AGPSO00116 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AGPSO00116 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AGPSO00116 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
AGPSO00116 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
AGPSO00116 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
AGPSO00116 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AGPSO00116 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
AGPSO00116 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
AGPSO00116 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
AGPSO00116 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
AGPSO00116 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
AGPSO00116 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
AGPSO00116 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
AGPSO00116 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
AGPSO00116 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
AGPSO00116 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
AGPSO00116 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
AGPSO00116 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
AGPSO00116 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
AGPSO00116 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
AGPSO00116 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
AGPSO00116 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
AGPSO00116 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
AGPSO00116 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
AGPSO00116 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
AGPSO00116 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
AGPSO00116 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
AGPSO00116 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
AGPSO00116 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
AGPSO00116 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AGPSO00116 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC21.32■■□□□ 1
AGPSO00116 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.32■■□□□ 1
AGPSO00116 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms