Protein–RNA interactions for Protein: J3KT08

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KT08 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
J3KT08 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
J3KT08 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
J3KT08 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
J3KT08 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
J3KT08 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
J3KT08 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
J3KT08 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
J3KT08 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
J3KT08 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
J3KT08 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
J3KT08 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
J3KT08 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
J3KT08 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
J3KT08 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
J3KT08 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
J3KT08 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
J3KT08 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
J3KT08 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
J3KT08 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
J3KT08 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
J3KT08 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
J3KT08 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
J3KT08 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
J3KT08 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
J3KT08 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
J3KT08 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
J3KT08 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
J3KT08 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
J3KT08 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
J3KT08 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
J3KT08 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
J3KT08 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
J3KT08 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
J3KT08 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
J3KT08 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
J3KT08 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
J3KT08 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
J3KT08 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
J3KT08 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
J3KT08 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
J3KT08 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
J3KT08 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
J3KT08 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
J3KT08 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
J3KT08 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
J3KT08 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
J3KT08 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
J3KT08 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
J3KT08 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
J3KT08 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
J3KT08 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
J3KT08 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
J3KT08 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
J3KT08 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
J3KT08 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
J3KT08 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
J3KT08 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
J3KT08 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
J3KT08 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
J3KT08 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
J3KT08 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
J3KT08 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
J3KT08 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
J3KT08 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
J3KT08 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
J3KT08 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
J3KT08 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
J3KT08 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
J3KT08 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
J3KT08 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
J3KT08 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
J3KT08 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
J3KT08 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
J3KT08 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
J3KT08 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
J3KT08 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
J3KT08 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
J3KT08 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
J3KT08 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
J3KT08 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
J3KT08 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
J3KT08 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
J3KT08 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
J3KT08 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
J3KT08 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
J3KT08 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
J3KT08 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
J3KT08 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
J3KT08 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
J3KT08 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
J3KT08 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
J3KT08 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
J3KT08 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
J3KT08 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
J3KT08 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
J3KT08 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
J3KT08 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.35
J3KT08 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC12.83□□□□□ -0.35
J3KT08 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms