Protein–RNA interactions for Protein: J3KSC0

LINC01387, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01387, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01387J3KSC0 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LINC01387J3KSC0 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LINC01387J3KSC0 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
LINC01387J3KSC0 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
LINC01387J3KSC0 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
LINC01387J3KSC0 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LINC01387J3KSC0 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LINC01387J3KSC0 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LINC01387J3KSC0 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LINC01387J3KSC0 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LINC01387J3KSC0 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LINC01387J3KSC0 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LINC01387J3KSC0 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LINC01387J3KSC0 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LINC01387J3KSC0 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LINC01387J3KSC0 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LINC01387J3KSC0 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LINC01387J3KSC0 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LINC01387J3KSC0 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LINC01387J3KSC0 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LINC01387J3KSC0 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LINC01387J3KSC0 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LINC01387J3KSC0 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LINC01387J3KSC0 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
LINC01387J3KSC0 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LINC01387J3KSC0 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LINC01387J3KSC0 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LINC01387J3KSC0 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LINC01387J3KSC0 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LINC01387J3KSC0 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
LINC01387J3KSC0 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
LINC01387J3KSC0 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LINC01387J3KSC0 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LINC01387J3KSC0 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LINC01387J3KSC0 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LINC01387J3KSC0 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LINC01387J3KSC0 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LINC01387J3KSC0 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
LINC01387J3KSC0 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LINC01387J3KSC0 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LINC01387J3KSC0 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LINC01387J3KSC0 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LINC01387J3KSC0 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LINC01387J3KSC0 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LINC01387J3KSC0 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LINC01387J3KSC0 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LINC01387J3KSC0 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LINC01387J3KSC0 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LINC01387J3KSC0 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LINC01387J3KSC0 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
LINC01387J3KSC0 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LINC01387J3KSC0 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LINC01387J3KSC0 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LINC01387J3KSC0 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LINC01387J3KSC0 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LINC01387J3KSC0 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LINC01387J3KSC0 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LINC01387J3KSC0 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LINC01387J3KSC0 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LINC01387J3KSC0 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LINC01387J3KSC0 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
LINC01387J3KSC0 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
LINC01387J3KSC0 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LINC01387J3KSC0 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LINC01387J3KSC0 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LINC01387J3KSC0 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LINC01387J3KSC0 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LINC01387J3KSC0 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LINC01387J3KSC0 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LINC01387J3KSC0 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LINC01387J3KSC0 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LINC01387J3KSC0 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LINC01387J3KSC0 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
LINC01387J3KSC0 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LINC01387J3KSC0 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LINC01387J3KSC0 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LINC01387J3KSC0 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LINC01387J3KSC0 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LINC01387J3KSC0 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LINC01387J3KSC0 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LINC01387J3KSC0 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LINC01387J3KSC0 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LINC01387J3KSC0 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
LINC01387J3KSC0 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LINC01387J3KSC0 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
LINC01387J3KSC0 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LINC01387J3KSC0 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LINC01387J3KSC0 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LINC01387J3KSC0 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LINC01387J3KSC0 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LINC01387J3KSC0 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LINC01387J3KSC0 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LINC01387J3KSC0 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LINC01387J3KSC0 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LINC01387J3KSC0 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LINC01387J3KSC0 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LINC01387J3KSC0 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LINC01387J3KSC0 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LINC01387J3KSC0 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LINC01387J3KSC0 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms