Protein–RNA interactions for Protein: F8WBC2

INMT-MINDY4, INMT-MINDY4 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INMT-MINDY4F8WBC2 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
INMT-MINDY4F8WBC2 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
INMT-MINDY4F8WBC2 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
INMT-MINDY4F8WBC2 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
INMT-MINDY4F8WBC2 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
INMT-MINDY4F8WBC2 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
INMT-MINDY4F8WBC2 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
INMT-MINDY4F8WBC2 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
INMT-MINDY4F8WBC2 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
INMT-MINDY4F8WBC2 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
INMT-MINDY4F8WBC2 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
INMT-MINDY4F8WBC2 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
INMT-MINDY4F8WBC2 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
INMT-MINDY4F8WBC2 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
INMT-MINDY4F8WBC2 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
INMT-MINDY4F8WBC2 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
INMT-MINDY4F8WBC2 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
INMT-MINDY4F8WBC2 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
INMT-MINDY4F8WBC2 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
INMT-MINDY4F8WBC2 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
INMT-MINDY4F8WBC2 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
INMT-MINDY4F8WBC2 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
INMT-MINDY4F8WBC2 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
INMT-MINDY4F8WBC2 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
INMT-MINDY4F8WBC2 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
INMT-MINDY4F8WBC2 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
INMT-MINDY4F8WBC2 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
INMT-MINDY4F8WBC2 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
INMT-MINDY4F8WBC2 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
INMT-MINDY4F8WBC2 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
INMT-MINDY4F8WBC2 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
INMT-MINDY4F8WBC2 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
INMT-MINDY4F8WBC2 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
INMT-MINDY4F8WBC2 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
INMT-MINDY4F8WBC2 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
INMT-MINDY4F8WBC2 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
INMT-MINDY4F8WBC2 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
INMT-MINDY4F8WBC2 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
INMT-MINDY4F8WBC2 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
INMT-MINDY4F8WBC2 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
INMT-MINDY4F8WBC2 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
INMT-MINDY4F8WBC2 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
INMT-MINDY4F8WBC2 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
INMT-MINDY4F8WBC2 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
INMT-MINDY4F8WBC2 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
INMT-MINDY4F8WBC2 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
INMT-MINDY4F8WBC2 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
INMT-MINDY4F8WBC2 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
INMT-MINDY4F8WBC2 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
INMT-MINDY4F8WBC2 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
INMT-MINDY4F8WBC2 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
INMT-MINDY4F8WBC2 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
INMT-MINDY4F8WBC2 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
INMT-MINDY4F8WBC2 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
INMT-MINDY4F8WBC2 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
INMT-MINDY4F8WBC2 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
INMT-MINDY4F8WBC2 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
INMT-MINDY4F8WBC2 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
INMT-MINDY4F8WBC2 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
INMT-MINDY4F8WBC2 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
INMT-MINDY4F8WBC2 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
INMT-MINDY4F8WBC2 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
INMT-MINDY4F8WBC2 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
INMT-MINDY4F8WBC2 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
INMT-MINDY4F8WBC2 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
INMT-MINDY4F8WBC2 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
INMT-MINDY4F8WBC2 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
INMT-MINDY4F8WBC2 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
INMT-MINDY4F8WBC2 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
INMT-MINDY4F8WBC2 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
INMT-MINDY4F8WBC2 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
INMT-MINDY4F8WBC2 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
INMT-MINDY4F8WBC2 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
INMT-MINDY4F8WBC2 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
INMT-MINDY4F8WBC2 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
INMT-MINDY4F8WBC2 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
INMT-MINDY4F8WBC2 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
INMT-MINDY4F8WBC2 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
INMT-MINDY4F8WBC2 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
INMT-MINDY4F8WBC2 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
INMT-MINDY4F8WBC2 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
INMT-MINDY4F8WBC2 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
INMT-MINDY4F8WBC2 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
INMT-MINDY4F8WBC2 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
INMT-MINDY4F8WBC2 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
INMT-MINDY4F8WBC2 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
INMT-MINDY4F8WBC2 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
INMT-MINDY4F8WBC2 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
INMT-MINDY4F8WBC2 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
INMT-MINDY4F8WBC2 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
INMT-MINDY4F8WBC2 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
INMT-MINDY4F8WBC2 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
INMT-MINDY4F8WBC2 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
INMT-MINDY4F8WBC2 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
INMT-MINDY4F8WBC2 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
INMT-MINDY4F8WBC2 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
INMT-MINDY4F8WBC2 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
INMT-MINDY4F8WBC2 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
INMT-MINDY4F8WBC2 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
INMT-MINDY4F8WBC2 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms