Protein–RNA interactions for Protein: D6R901

USP17L21, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 21, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L21D6R901 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
USP17L21D6R901 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP17L21D6R901 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP17L21D6R901 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP17L21D6R901 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP17L21D6R901 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP17L21D6R901 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP17L21D6R901 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP17L21D6R901 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP17L21D6R901 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP17L21D6R901 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP17L21D6R901 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
USP17L21D6R901 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP17L21D6R901 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP17L21D6R901 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
USP17L21D6R901 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP17L21D6R901 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP17L21D6R901 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP17L21D6R901 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP17L21D6R901 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP17L21D6R901 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP17L21D6R901 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP17L21D6R901 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP17L21D6R901 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP17L21D6R901 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP17L21D6R901 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
USP17L21D6R901 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP17L21D6R901 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP17L21D6R901 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP17L21D6R901 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP17L21D6R901 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP17L21D6R901 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP17L21D6R901 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP17L21D6R901 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP17L21D6R901 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP17L21D6R901 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP17L21D6R901 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP17L21D6R901 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP17L21D6R901 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP17L21D6R901 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP17L21D6R901 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP17L21D6R901 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP17L21D6R901 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP17L21D6R901 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP17L21D6R901 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
USP17L21D6R901 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP17L21D6R901 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP17L21D6R901 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP17L21D6R901 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP17L21D6R901 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP17L21D6R901 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP17L21D6R901 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
USP17L21D6R901 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP17L21D6R901 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP17L21D6R901 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP17L21D6R901 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP17L21D6R901 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP17L21D6R901 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP17L21D6R901 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP17L21D6R901 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
USP17L21D6R901 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP17L21D6R901 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP17L21D6R901 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP17L21D6R901 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP17L21D6R901 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
USP17L21D6R901 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP17L21D6R901 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP17L21D6R901 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP17L21D6R901 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP17L21D6R901 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP17L21D6R901 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP17L21D6R901 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
USP17L21D6R901 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP17L21D6R901 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP17L21D6R901 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP17L21D6R901 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP17L21D6R901 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP17L21D6R901 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP17L21D6R901 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP17L21D6R901 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP17L21D6R901 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP17L21D6R901 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP17L21D6R901 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP17L21D6R901 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP17L21D6R901 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP17L21D6R901 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP17L21D6R901 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP17L21D6R901 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
USP17L21D6R901 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP17L21D6R901 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
USP17L21D6R901 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP17L21D6R901 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP17L21D6R901 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP17L21D6R901 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP17L21D6R901 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP17L21D6R901 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP17L21D6R901 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP17L21D6R901 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP17L21D6R901 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP17L21D6R901 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms