Protein–RNA interactions for Protein: A8K830

COLCA2, Colorectal cancer-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COLCA2A8K830 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
COLCA2A8K830 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
COLCA2A8K830 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
COLCA2A8K830 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
COLCA2A8K830 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
COLCA2A8K830 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
COLCA2A8K830 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
COLCA2A8K830 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
COLCA2A8K830 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
COLCA2A8K830 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
COLCA2A8K830 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
COLCA2A8K830 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
COLCA2A8K830 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
COLCA2A8K830 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COLCA2A8K830 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COLCA2A8K830 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COLCA2A8K830 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COLCA2A8K830 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COLCA2A8K830 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COLCA2A8K830 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COLCA2A8K830 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COLCA2A8K830 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COLCA2A8K830 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COLCA2A8K830 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COLCA2A8K830 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COLCA2A8K830 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COLCA2A8K830 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COLCA2A8K830 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COLCA2A8K830 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
COLCA2A8K830 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COLCA2A8K830 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COLCA2A8K830 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COLCA2A8K830 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COLCA2A8K830 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COLCA2A8K830 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COLCA2A8K830 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COLCA2A8K830 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COLCA2A8K830 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
COLCA2A8K830 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COLCA2A8K830 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COLCA2A8K830 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
COLCA2A8K830 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
COLCA2A8K830 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COLCA2A8K830 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
COLCA2A8K830 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COLCA2A8K830 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
COLCA2A8K830 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
COLCA2A8K830 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
COLCA2A8K830 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COLCA2A8K830 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COLCA2A8K830 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COLCA2A8K830 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COLCA2A8K830 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
COLCA2A8K830 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COLCA2A8K830 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
COLCA2A8K830 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
COLCA2A8K830 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COLCA2A8K830 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COLCA2A8K830 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COLCA2A8K830 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COLCA2A8K830 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COLCA2A8K830 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
COLCA2A8K830 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COLCA2A8K830 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COLCA2A8K830 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COLCA2A8K830 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COLCA2A8K830 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COLCA2A8K830 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COLCA2A8K830 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COLCA2A8K830 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
COLCA2A8K830 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COLCA2A8K830 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COLCA2A8K830 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COLCA2A8K830 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COLCA2A8K830 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COLCA2A8K830 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COLCA2A8K830 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COLCA2A8K830 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COLCA2A8K830 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COLCA2A8K830 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COLCA2A8K830 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COLCA2A8K830 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COLCA2A8K830 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COLCA2A8K830 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COLCA2A8K830 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COLCA2A8K830 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COLCA2A8K830 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COLCA2A8K830 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COLCA2A8K830 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COLCA2A8K830 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COLCA2A8K830 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COLCA2A8K830 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COLCA2A8K830 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COLCA2A8K830 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COLCA2A8K830 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COLCA2A8K830 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COLCA2A8K830 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COLCA2A8K830 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COLCA2A8K830 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COLCA2A8K830 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11 ms