Protein–RNA interactions for Protein: A6NFI3

ZNF316, Zinc finger protein 316, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF316A6NFI3 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
ZNF316A6NFI3 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
ZNF316A6NFI3 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
ZNF316A6NFI3 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
ZNF316A6NFI3 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
ZNF316A6NFI3 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
ZNF316A6NFI3 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
ZNF316A6NFI3 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
ZNF316A6NFI3 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
ZNF316A6NFI3 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
ZNF316A6NFI3 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
ZNF316A6NFI3 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ZNF316A6NFI3 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
ZNF316A6NFI3 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
ZNF316A6NFI3 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ZNF316A6NFI3 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
ZNF316A6NFI3 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
ZNF316A6NFI3 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
ZNF316A6NFI3 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
ZNF316A6NFI3 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
ZNF316A6NFI3 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
ZNF316A6NFI3 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
ZNF316A6NFI3 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
ZNF316A6NFI3 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
ZNF316A6NFI3 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
ZNF316A6NFI3 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
ZNF316A6NFI3 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
ZNF316A6NFI3 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
ZNF316A6NFI3 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
ZNF316A6NFI3 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
ZNF316A6NFI3 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
ZNF316A6NFI3 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
ZNF316A6NFI3 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
ZNF316A6NFI3 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
ZNF316A6NFI3 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
ZNF316A6NFI3 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
ZNF316A6NFI3 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
ZNF316A6NFI3 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
ZNF316A6NFI3 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
ZNF316A6NFI3 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
ZNF316A6NFI3 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
ZNF316A6NFI3 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
ZNF316A6NFI3 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
ZNF316A6NFI3 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
ZNF316A6NFI3 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
ZNF316A6NFI3 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
ZNF316A6NFI3 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
ZNF316A6NFI3 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
ZNF316A6NFI3 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
ZNF316A6NFI3 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
ZNF316A6NFI3 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
ZNF316A6NFI3 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
ZNF316A6NFI3 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.3
ZNF316A6NFI3 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.3
ZNF316A6NFI3 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.3
ZNF316A6NFI3 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
ZNF316A6NFI3 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
ZNF316A6NFI3 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
ZNF316A6NFI3 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
ZNF316A6NFI3 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
ZNF316A6NFI3 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
ZNF316A6NFI3 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
ZNF316A6NFI3 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
ZNF316A6NFI3 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
ZNF316A6NFI3 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
ZNF316A6NFI3 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC29.44■■■□□ 2.3
ZNF316A6NFI3 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
ZNF316A6NFI3 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
ZNF316A6NFI3 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
ZNF316A6NFI3 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
ZNF316A6NFI3 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
ZNF316A6NFI3 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
ZNF316A6NFI3 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
ZNF316A6NFI3 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
ZNF316A6NFI3 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
ZNF316A6NFI3 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
ZNF316A6NFI3 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
ZNF316A6NFI3 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
ZNF316A6NFI3 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
ZNF316A6NFI3 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
ZNF316A6NFI3 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
ZNF316A6NFI3 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
ZNF316A6NFI3 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
ZNF316A6NFI3 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
ZNF316A6NFI3 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
ZNF316A6NFI3 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
ZNF316A6NFI3 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
ZNF316A6NFI3 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
ZNF316A6NFI3 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
ZNF316A6NFI3 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
ZNF316A6NFI3 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
ZNF316A6NFI3 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
ZNF316A6NFI3 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
ZNF316A6NFI3 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
ZNF316A6NFI3 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
ZNF316A6NFI3 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
ZNF316A6NFI3 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
ZNF316A6NFI3 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
ZNF316A6NFI3 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
ZNF316A6NFI3 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85 ms