Protein–RNA interactions for Protein: A6NE82

MBD3L3, Putative methyl-CpG-binding domain protein 3-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD3L3A6NE82 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MBD3L3A6NE82 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MBD3L3A6NE82 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MBD3L3A6NE82 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MBD3L3A6NE82 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MBD3L3A6NE82 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MBD3L3A6NE82 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
MBD3L3A6NE82 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MBD3L3A6NE82 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MBD3L3A6NE82 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MBD3L3A6NE82 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MBD3L3A6NE82 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MBD3L3A6NE82 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MBD3L3A6NE82 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MBD3L3A6NE82 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MBD3L3A6NE82 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MBD3L3A6NE82 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MBD3L3A6NE82 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MBD3L3A6NE82 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MBD3L3A6NE82 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MBD3L3A6NE82 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MBD3L3A6NE82 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MBD3L3A6NE82 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MBD3L3A6NE82 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MBD3L3A6NE82 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MBD3L3A6NE82 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MBD3L3A6NE82 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MBD3L3A6NE82 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MBD3L3A6NE82 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
MBD3L3A6NE82 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MBD3L3A6NE82 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MBD3L3A6NE82 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MBD3L3A6NE82 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
MBD3L3A6NE82 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MBD3L3A6NE82 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MBD3L3A6NE82 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MBD3L3A6NE82 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MBD3L3A6NE82 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MBD3L3A6NE82 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MBD3L3A6NE82 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MBD3L3A6NE82 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MBD3L3A6NE82 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MBD3L3A6NE82 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MBD3L3A6NE82 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MBD3L3A6NE82 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MBD3L3A6NE82 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MBD3L3A6NE82 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MBD3L3A6NE82 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MBD3L3A6NE82 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MBD3L3A6NE82 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MBD3L3A6NE82 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MBD3L3A6NE82 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MBD3L3A6NE82 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MBD3L3A6NE82 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MBD3L3A6NE82 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
MBD3L3A6NE82 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
MBD3L3A6NE82 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MBD3L3A6NE82 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MBD3L3A6NE82 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MBD3L3A6NE82 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MBD3L3A6NE82 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MBD3L3A6NE82 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MBD3L3A6NE82 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MBD3L3A6NE82 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MBD3L3A6NE82 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MBD3L3A6NE82 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MBD3L3A6NE82 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MBD3L3A6NE82 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MBD3L3A6NE82 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MBD3L3A6NE82 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MBD3L3A6NE82 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MBD3L3A6NE82 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MBD3L3A6NE82 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MBD3L3A6NE82 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MBD3L3A6NE82 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MBD3L3A6NE82 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MBD3L3A6NE82 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MBD3L3A6NE82 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MBD3L3A6NE82 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MBD3L3A6NE82 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MBD3L3A6NE82 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MBD3L3A6NE82 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MBD3L3A6NE82 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MBD3L3A6NE82 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
MBD3L3A6NE82 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MBD3L3A6NE82 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MBD3L3A6NE82 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MBD3L3A6NE82 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MBD3L3A6NE82 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
MBD3L3A6NE82 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MBD3L3A6NE82 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MBD3L3A6NE82 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
MBD3L3A6NE82 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MBD3L3A6NE82 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MBD3L3A6NE82 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MBD3L3A6NE82 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
MBD3L3A6NE82 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MBD3L3A6NE82 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MBD3L3A6NE82 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MBD3L3A6NE82 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms