Protein–RNA interactions for Protein: A4D1B5

GSAP, Gamma-secretase-activating protein, humanhuman

Predictions only

Length 854 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSAPA4D1B5 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GSAPA4D1B5 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GSAPA4D1B5 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GSAPA4D1B5 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GSAPA4D1B5 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GSAPA4D1B5 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GSAPA4D1B5 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GSAPA4D1B5 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GSAPA4D1B5 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GSAPA4D1B5 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GSAPA4D1B5 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GSAPA4D1B5 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GSAPA4D1B5 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GSAPA4D1B5 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GSAPA4D1B5 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GSAPA4D1B5 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GSAPA4D1B5 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GSAPA4D1B5 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GSAPA4D1B5 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
GSAPA4D1B5 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GSAPA4D1B5 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GSAPA4D1B5 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GSAPA4D1B5 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
GSAPA4D1B5 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GSAPA4D1B5 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GSAPA4D1B5 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GSAPA4D1B5 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GSAPA4D1B5 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GSAPA4D1B5 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GSAPA4D1B5 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GSAPA4D1B5 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GSAPA4D1B5 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GSAPA4D1B5 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GSAPA4D1B5 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GSAPA4D1B5 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GSAPA4D1B5 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GSAPA4D1B5 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GSAPA4D1B5 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GSAPA4D1B5 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GSAPA4D1B5 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GSAPA4D1B5 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GSAPA4D1B5 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GSAPA4D1B5 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
GSAPA4D1B5 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GSAPA4D1B5 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GSAPA4D1B5 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
GSAPA4D1B5 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
GSAPA4D1B5 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GSAPA4D1B5 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GSAPA4D1B5 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GSAPA4D1B5 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GSAPA4D1B5 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GSAPA4D1B5 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GSAPA4D1B5 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GSAPA4D1B5 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GSAPA4D1B5 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GSAPA4D1B5 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GSAPA4D1B5 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GSAPA4D1B5 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GSAPA4D1B5 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GSAPA4D1B5 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GSAPA4D1B5 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GSAPA4D1B5 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
GSAPA4D1B5 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
GSAPA4D1B5 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
GSAPA4D1B5 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GSAPA4D1B5 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GSAPA4D1B5 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GSAPA4D1B5 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GSAPA4D1B5 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GSAPA4D1B5 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GSAPA4D1B5 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GSAPA4D1B5 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GSAPA4D1B5 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GSAPA4D1B5 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GSAPA4D1B5 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GSAPA4D1B5 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GSAPA4D1B5 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GSAPA4D1B5 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GSAPA4D1B5 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GSAPA4D1B5 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GSAPA4D1B5 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GSAPA4D1B5 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GSAPA4D1B5 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GSAPA4D1B5 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
GSAPA4D1B5 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GSAPA4D1B5 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GSAPA4D1B5 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GSAPA4D1B5 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GSAPA4D1B5 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GSAPA4D1B5 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GSAPA4D1B5 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GSAPA4D1B5 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GSAPA4D1B5 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GSAPA4D1B5 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GSAPA4D1B5 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GSAPA4D1B5 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GSAPA4D1B5 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GSAPA4D1B5 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GSAPA4D1B5 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms