Protein–RNA interactions for Protein: A2RUR9

CCDC144A, Coiled-coil domain-containing protein 144A, humanhuman

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC144AA2RUR9 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CCDC144AA2RUR9 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CCDC144AA2RUR9 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
CCDC144AA2RUR9 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC30■■■□□ 2.39
CCDC144AA2RUR9 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CCDC144AA2RUR9 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CCDC144AA2RUR9 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CCDC144AA2RUR9 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
CCDC144AA2RUR9 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CCDC144AA2RUR9 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
CCDC144AA2RUR9 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
CCDC144AA2RUR9 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CCDC144AA2RUR9 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CCDC144AA2RUR9 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CCDC144AA2RUR9 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CCDC144AA2RUR9 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
CCDC144AA2RUR9 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
CCDC144AA2RUR9 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
CCDC144AA2RUR9 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
CCDC144AA2RUR9 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC29.99■■■□□ 2.39
CCDC144AA2RUR9 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CCDC144AA2RUR9 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CCDC144AA2RUR9 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CCDC144AA2RUR9 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CCDC144AA2RUR9 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CCDC144AA2RUR9 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CCDC144AA2RUR9 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CCDC144AA2RUR9 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
CCDC144AA2RUR9 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
CCDC144AA2RUR9 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
CCDC144AA2RUR9 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
CCDC144AA2RUR9 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CCDC144AA2RUR9 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CCDC144AA2RUR9 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
CCDC144AA2RUR9 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
CCDC144AA2RUR9 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
CCDC144AA2RUR9 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
CCDC144AA2RUR9 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CCDC144AA2RUR9 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
CCDC144AA2RUR9 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
CCDC144AA2RUR9 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
CCDC144AA2RUR9 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
CCDC144AA2RUR9 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
CCDC144AA2RUR9 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CCDC144AA2RUR9 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CCDC144AA2RUR9 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CCDC144AA2RUR9 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CCDC144AA2RUR9 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
CCDC144AA2RUR9 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CCDC144AA2RUR9 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CCDC144AA2RUR9 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CCDC144AA2RUR9 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
CCDC144AA2RUR9 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CCDC144AA2RUR9 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CCDC144AA2RUR9 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CCDC144AA2RUR9 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CCDC144AA2RUR9 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CCDC144AA2RUR9 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CCDC144AA2RUR9 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CCDC144AA2RUR9 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
CCDC144AA2RUR9 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CCDC144AA2RUR9 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
CCDC144AA2RUR9 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
CCDC144AA2RUR9 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
CCDC144AA2RUR9 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
CCDC144AA2RUR9 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
CCDC144AA2RUR9 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
CCDC144AA2RUR9 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
CCDC144AA2RUR9 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
CCDC144AA2RUR9 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC29.95■■■□□ 2.38
CCDC144AA2RUR9 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
CCDC144AA2RUR9 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
CCDC144AA2RUR9 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
CCDC144AA2RUR9 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC29.95■■■□□ 2.38
CCDC144AA2RUR9 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC29.95■■■□□ 2.38
CCDC144AA2RUR9 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CCDC144AA2RUR9 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CCDC144AA2RUR9 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CCDC144AA2RUR9 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CCDC144AA2RUR9 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CCDC144AA2RUR9 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CCDC144AA2RUR9 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CCDC144AA2RUR9 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CCDC144AA2RUR9 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CCDC144AA2RUR9 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CCDC144AA2RUR9 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CCDC144AA2RUR9 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CCDC144AA2RUR9 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CCDC144AA2RUR9 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CCDC144AA2RUR9 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CCDC144AA2RUR9 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
CCDC144AA2RUR9 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CCDC144AA2RUR9 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CCDC144AA2RUR9 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CCDC144AA2RUR9 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CCDC144AA2RUR9 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
CCDC144AA2RUR9 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CCDC144AA2RUR9 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CCDC144AA2RUR9 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CCDC144AA2RUR9 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms