Protein–RNA interactions for Protein: A0A539

TCRBV7S3A2, T-cell receptor beta variable 4-2 (Fragment), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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TCRBV7S3A2A0A539 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TCRBV7S3A2A0A539 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
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TCRBV7S3A2A0A539 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TCRBV7S3A2A0A539 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TCRBV7S3A2A0A539 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TCRBV7S3A2A0A539 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
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TCRBV7S3A2A0A539 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TCRBV7S3A2A0A539 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TCRBV7S3A2A0A539 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TCRBV7S3A2A0A539 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TCRBV7S3A2A0A539 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TCRBV7S3A2A0A539 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
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TCRBV7S3A2A0A539 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
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TCRBV7S3A2A0A539 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
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