Protein–RNA interactions for Protein: A0A1W2PRG0

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A1W2PRG0 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
A0A1W2PRG0 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
A0A1W2PRG0 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
A0A1W2PRG0 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
A0A1W2PRG0 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
A0A1W2PRG0 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
A0A1W2PRG0 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
A0A1W2PRG0 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
A0A1W2PRG0 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
A0A1W2PRG0 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
A0A1W2PRG0 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
A0A1W2PRG0 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
A0A1W2PRG0 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
A0A1W2PRG0 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
A0A1W2PRG0 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
A0A1W2PRG0 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
A0A1W2PRG0 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
A0A1W2PRG0 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
A0A1W2PRG0 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
A0A1W2PRG0 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
A0A1W2PRG0 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
A0A1W2PRG0 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
A0A1W2PRG0 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
A0A1W2PRG0 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
A0A1W2PRG0 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
A0A1W2PRG0 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
A0A1W2PRG0 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
A0A1W2PRG0 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
A0A1W2PRG0 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
A0A1W2PRG0 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
A0A1W2PRG0 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
A0A1W2PRG0 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
A0A1W2PRG0 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
A0A1W2PRG0 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
A0A1W2PRG0 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
A0A1W2PRG0 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
A0A1W2PRG0 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
A0A1W2PRG0 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
A0A1W2PRG0 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
A0A1W2PRG0 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
A0A1W2PRG0 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
A0A1W2PRG0 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
A0A1W2PRG0 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
A0A1W2PRG0 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
A0A1W2PRG0 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
A0A1W2PRG0 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
A0A1W2PRG0 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
A0A1W2PRG0 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
A0A1W2PRG0 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
A0A1W2PRG0 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
A0A1W2PRG0 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
A0A1W2PRG0 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
A0A1W2PRG0 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
A0A1W2PRG0 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
A0A1W2PRG0 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
A0A1W2PRG0 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
A0A1W2PRG0 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
A0A1W2PRG0 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
A0A1W2PRG0 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
A0A1W2PRG0 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
A0A1W2PRG0 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
A0A1W2PRG0 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
A0A1W2PRG0 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
A0A1W2PRG0 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
A0A1W2PRG0 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
A0A1W2PRG0 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
A0A1W2PRG0 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
A0A1W2PRG0 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
A0A1W2PRG0 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
A0A1W2PRG0 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
A0A1W2PRG0 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
A0A1W2PRG0 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
A0A1W2PRG0 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
A0A1W2PRG0 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
A0A1W2PRG0 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
A0A1W2PRG0 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
A0A1W2PRG0 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
A0A1W2PRG0 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
A0A1W2PRG0 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
A0A1W2PRG0 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
A0A1W2PRG0 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
A0A1W2PRG0 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
A0A1W2PRG0 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
A0A1W2PRG0 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
A0A1W2PRG0 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
A0A1W2PRG0 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
A0A1W2PRG0 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
A0A1W2PRG0 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
A0A1W2PRG0 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
A0A1W2PRG0 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
A0A1W2PRG0 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
A0A1W2PRG0 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
A0A1W2PRG0 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
A0A1W2PRG0 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
A0A1W2PRG0 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
A0A1W2PRG0 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
A0A1W2PRG0 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
A0A1W2PRG0 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
A0A1W2PRG0 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
A0A1W2PRG0 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms