Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5U5

TNFRSF18, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 18, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF18Q9Y5U5 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
TNFRSF18Q9Y5U5 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
TNFRSF18Q9Y5U5 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TNFRSF18Q9Y5U5 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
TNFRSF18Q9Y5U5 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TNFRSF18Q9Y5U5 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TNFRSF18Q9Y5U5 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TNFRSF18Q9Y5U5 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TNFRSF18Q9Y5U5 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TNFRSF18Q9Y5U5 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TNFRSF18Q9Y5U5 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TNFRSF18Q9Y5U5 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TNFRSF18Q9Y5U5 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TNFRSF18Q9Y5U5 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TNFRSF18Q9Y5U5 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TNFRSF18Q9Y5U5 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
TNFRSF18Q9Y5U5 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TNFRSF18Q9Y5U5 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TNFRSF18Q9Y5U5 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TNFRSF18Q9Y5U5 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TNFRSF18Q9Y5U5 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TNFRSF18Q9Y5U5 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TNFRSF18Q9Y5U5 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TNFRSF18Q9Y5U5 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TNFRSF18Q9Y5U5 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TNFRSF18Q9Y5U5 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
TNFRSF18Q9Y5U5 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TNFRSF18Q9Y5U5 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TNFRSF18Q9Y5U5 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TNFRSF18Q9Y5U5 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
TNFRSF18Q9Y5U5 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TNFRSF18Q9Y5U5 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TNFRSF18Q9Y5U5 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TNFRSF18Q9Y5U5 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TNFRSF18Q9Y5U5 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TNFRSF18Q9Y5U5 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TNFRSF18Q9Y5U5 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
TNFRSF18Q9Y5U5 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TNFRSF18Q9Y5U5 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TNFRSF18Q9Y5U5 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TNFRSF18Q9Y5U5 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TNFRSF18Q9Y5U5 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TNFRSF18Q9Y5U5 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TNFRSF18Q9Y5U5 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TNFRSF18Q9Y5U5 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TNFRSF18Q9Y5U5 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TNFRSF18Q9Y5U5 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TNFRSF18Q9Y5U5 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
TNFRSF18Q9Y5U5 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TNFRSF18Q9Y5U5 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TNFRSF18Q9Y5U5 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TNFRSF18Q9Y5U5 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TNFRSF18Q9Y5U5 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TNFRSF18Q9Y5U5 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
TNFRSF18Q9Y5U5 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TNFRSF18Q9Y5U5 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TNFRSF18Q9Y5U5 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TNFRSF18Q9Y5U5 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TNFRSF18Q9Y5U5 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TNFRSF18Q9Y5U5 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TNFRSF18Q9Y5U5 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TNFRSF18Q9Y5U5 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TNFRSF18Q9Y5U5 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TNFRSF18Q9Y5U5 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TNFRSF18Q9Y5U5 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TNFRSF18Q9Y5U5 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TNFRSF18Q9Y5U5 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TNFRSF18Q9Y5U5 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TNFRSF18Q9Y5U5 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TNFRSF18Q9Y5U5 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC15.02■□□□□ -0
TNFRSF18Q9Y5U5 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TNFRSF18Q9Y5U5 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TNFRSF18Q9Y5U5 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TNFRSF18Q9Y5U5 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TNFRSF18Q9Y5U5 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TNFRSF18Q9Y5U5 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC15.02■□□□□ -0
TNFRSF18Q9Y5U5 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC15.02■□□□□ -0
TNFRSF18Q9Y5U5 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TNFRSF18Q9Y5U5 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
TNFRSF18Q9Y5U5 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TNFRSF18Q9Y5U5 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC15.02■□□□□ -0
TNFRSF18Q9Y5U5 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TNFRSF18Q9Y5U5 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TNFRSF18Q9Y5U5 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TNFRSF18Q9Y5U5 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TNFRSF18Q9Y5U5 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TNFRSF18Q9Y5U5 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TNFRSF18Q9Y5U5 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
TNFRSF18Q9Y5U5 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TNFRSF18Q9Y5U5 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TNFRSF18Q9Y5U5 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TNFRSF18Q9Y5U5 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TNFRSF18Q9Y5U5 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TNFRSF18Q9Y5U5 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
TNFRSF18Q9Y5U5 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TNFRSF18Q9Y5U5 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TNFRSF18Q9Y5U5 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TNFRSF18Q9Y5U5 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TNFRSF18Q9Y5U5 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TNFRSF18Q9Y5U5 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms