Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4A8

NFE2L3, Nuclear factor erythroid 2-related factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFE2L3Q9Y4A8 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NFE2L3Q9Y4A8 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NFE2L3Q9Y4A8 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NFE2L3Q9Y4A8 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NFE2L3Q9Y4A8 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NFE2L3Q9Y4A8 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NFE2L3Q9Y4A8 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NFE2L3Q9Y4A8 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NFE2L3Q9Y4A8 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NFE2L3Q9Y4A8 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NFE2L3Q9Y4A8 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NFE2L3Q9Y4A8 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NFE2L3Q9Y4A8 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NFE2L3Q9Y4A8 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NFE2L3Q9Y4A8 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NFE2L3Q9Y4A8 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NFE2L3Q9Y4A8 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
NFE2L3Q9Y4A8 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
NFE2L3Q9Y4A8 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
NFE2L3Q9Y4A8 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NFE2L3Q9Y4A8 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NFE2L3Q9Y4A8 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NFE2L3Q9Y4A8 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
NFE2L3Q9Y4A8 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NFE2L3Q9Y4A8 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NFE2L3Q9Y4A8 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NFE2L3Q9Y4A8 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NFE2L3Q9Y4A8 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NFE2L3Q9Y4A8 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NFE2L3Q9Y4A8 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NFE2L3Q9Y4A8 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NFE2L3Q9Y4A8 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NFE2L3Q9Y4A8 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NFE2L3Q9Y4A8 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NFE2L3Q9Y4A8 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NFE2L3Q9Y4A8 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NFE2L3Q9Y4A8 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NFE2L3Q9Y4A8 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NFE2L3Q9Y4A8 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NFE2L3Q9Y4A8 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NFE2L3Q9Y4A8 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NFE2L3Q9Y4A8 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NFE2L3Q9Y4A8 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NFE2L3Q9Y4A8 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NFE2L3Q9Y4A8 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NFE2L3Q9Y4A8 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NFE2L3Q9Y4A8 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NFE2L3Q9Y4A8 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NFE2L3Q9Y4A8 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NFE2L3Q9Y4A8 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NFE2L3Q9Y4A8 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NFE2L3Q9Y4A8 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
NFE2L3Q9Y4A8 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NFE2L3Q9Y4A8 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NFE2L3Q9Y4A8 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NFE2L3Q9Y4A8 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NFE2L3Q9Y4A8 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NFE2L3Q9Y4A8 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NFE2L3Q9Y4A8 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NFE2L3Q9Y4A8 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NFE2L3Q9Y4A8 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NFE2L3Q9Y4A8 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NFE2L3Q9Y4A8 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NFE2L3Q9Y4A8 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NFE2L3Q9Y4A8 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NFE2L3Q9Y4A8 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NFE2L3Q9Y4A8 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
NFE2L3Q9Y4A8 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NFE2L3Q9Y4A8 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NFE2L3Q9Y4A8 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NFE2L3Q9Y4A8 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NFE2L3Q9Y4A8 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NFE2L3Q9Y4A8 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NFE2L3Q9Y4A8 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NFE2L3Q9Y4A8 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NFE2L3Q9Y4A8 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NFE2L3Q9Y4A8 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NFE2L3Q9Y4A8 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NFE2L3Q9Y4A8 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NFE2L3Q9Y4A8 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NFE2L3Q9Y4A8 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NFE2L3Q9Y4A8 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NFE2L3Q9Y4A8 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NFE2L3Q9Y4A8 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NFE2L3Q9Y4A8 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NFE2L3Q9Y4A8 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NFE2L3Q9Y4A8 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NFE2L3Q9Y4A8 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NFE2L3Q9Y4A8 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NFE2L3Q9Y4A8 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NFE2L3Q9Y4A8 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NFE2L3Q9Y4A8 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NFE2L3Q9Y4A8 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NFE2L3Q9Y4A8 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NFE2L3Q9Y4A8 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NFE2L3Q9Y4A8 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NFE2L3Q9Y4A8 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NFE2L3Q9Y4A8 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NFE2L3Q9Y4A8 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NFE2L3Q9Y4A8 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
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