Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y496

KIF3A, Kinesin-like protein KIF3A, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF3AQ9Y496 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KIF3AQ9Y496 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KIF3AQ9Y496 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KIF3AQ9Y496 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KIF3AQ9Y496 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KIF3AQ9Y496 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KIF3AQ9Y496 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KIF3AQ9Y496 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KIF3AQ9Y496 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KIF3AQ9Y496 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KIF3AQ9Y496 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KIF3AQ9Y496 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KIF3AQ9Y496 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KIF3AQ9Y496 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KIF3AQ9Y496 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KIF3AQ9Y496 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KIF3AQ9Y496 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KIF3AQ9Y496 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KIF3AQ9Y496 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KIF3AQ9Y496 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KIF3AQ9Y496 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KIF3AQ9Y496 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KIF3AQ9Y496 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KIF3AQ9Y496 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KIF3AQ9Y496 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KIF3AQ9Y496 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KIF3AQ9Y496 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KIF3AQ9Y496 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KIF3AQ9Y496 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KIF3AQ9Y496 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KIF3AQ9Y496 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KIF3AQ9Y496 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KIF3AQ9Y496 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KIF3AQ9Y496 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KIF3AQ9Y496 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KIF3AQ9Y496 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KIF3AQ9Y496 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KIF3AQ9Y496 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KIF3AQ9Y496 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KIF3AQ9Y496 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
KIF3AQ9Y496 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KIF3AQ9Y496 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KIF3AQ9Y496 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KIF3AQ9Y496 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KIF3AQ9Y496 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KIF3AQ9Y496 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KIF3AQ9Y496 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KIF3AQ9Y496 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KIF3AQ9Y496 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KIF3AQ9Y496 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
KIF3AQ9Y496 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KIF3AQ9Y496 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KIF3AQ9Y496 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KIF3AQ9Y496 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KIF3AQ9Y496 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KIF3AQ9Y496 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
KIF3AQ9Y496 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KIF3AQ9Y496 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
KIF3AQ9Y496 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KIF3AQ9Y496 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KIF3AQ9Y496 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KIF3AQ9Y496 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KIF3AQ9Y496 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KIF3AQ9Y496 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KIF3AQ9Y496 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KIF3AQ9Y496 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KIF3AQ9Y496 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KIF3AQ9Y496 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KIF3AQ9Y496 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KIF3AQ9Y496 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KIF3AQ9Y496 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KIF3AQ9Y496 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KIF3AQ9Y496 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
KIF3AQ9Y496 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KIF3AQ9Y496 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
KIF3AQ9Y496 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KIF3AQ9Y496 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KIF3AQ9Y496 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KIF3AQ9Y496 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KIF3AQ9Y496 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KIF3AQ9Y496 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KIF3AQ9Y496 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KIF3AQ9Y496 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KIF3AQ9Y496 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KIF3AQ9Y496 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KIF3AQ9Y496 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KIF3AQ9Y496 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
KIF3AQ9Y496 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KIF3AQ9Y496 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KIF3AQ9Y496 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
KIF3AQ9Y496 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KIF3AQ9Y496 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KIF3AQ9Y496 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KIF3AQ9Y496 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KIF3AQ9Y496 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KIF3AQ9Y496 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
KIF3AQ9Y496 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KIF3AQ9Y496 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KIF3AQ9Y496 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KIF3AQ9Y496 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms