Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3F1

Putative TAP2-associated 6.5 kDa polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9Y3F1 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Q9Y3F1 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Q9Y3F1 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Q9Y3F1 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Q9Y3F1 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Q9Y3F1 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Q9Y3F1 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Q9Y3F1 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Q9Y3F1 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Q9Y3F1 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Q9Y3F1 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Q9Y3F1 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Q9Y3F1 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Q9Y3F1 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Q9Y3F1 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Q9Y3F1 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Q9Y3F1 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Q9Y3F1 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Q9Y3F1 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Q9Y3F1 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Q9Y3F1 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Q9Y3F1 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Q9Y3F1 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Q9Y3F1 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Q9Y3F1 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Q9Y3F1 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Q9Y3F1 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Q9Y3F1 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Q9Y3F1 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Q9Y3F1 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Q9Y3F1 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Q9Y3F1 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Q9Y3F1 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Q9Y3F1 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Q9Y3F1 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Q9Y3F1 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Q9Y3F1 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Q9Y3F1 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Q9Y3F1 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Q9Y3F1 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Q9Y3F1 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Q9Y3F1 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Q9Y3F1 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Q9Y3F1 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Q9Y3F1 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Q9Y3F1 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Q9Y3F1 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Q9Y3F1 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Q9Y3F1 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Q9Y3F1 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Q9Y3F1 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Q9Y3F1 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Q9Y3F1 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Q9Y3F1 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Q9Y3F1 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Q9Y3F1 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Q9Y3F1 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Q9Y3F1 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Q9Y3F1 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Q9Y3F1 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Q9Y3F1 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Q9Y3F1 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Q9Y3F1 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Q9Y3F1 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Q9Y3F1 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Q9Y3F1 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Q9Y3F1 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Q9Y3F1 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Q9Y3F1 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Q9Y3F1 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Q9Y3F1 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Q9Y3F1 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Q9Y3F1 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Q9Y3F1 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Q9Y3F1 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Q9Y3F1 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Q9Y3F1 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Q9Y3F1 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Q9Y3F1 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Q9Y3F1 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Q9Y3F1 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Q9Y3F1 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Q9Y3F1 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Q9Y3F1 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Q9Y3F1 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Q9Y3F1 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Q9Y3F1 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Q9Y3F1 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Q9Y3F1 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Q9Y3F1 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Q9Y3F1 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Q9Y3F1 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Q9Y3F1 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Q9Y3F1 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Q9Y3F1 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Q9Y3F1 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Q9Y3F1 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Q9Y3F1 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Q9Y3F1 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Q9Y3F1 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms