Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3E1

HDGFL3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL3Q9Y3E1 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HDGFL3Q9Y3E1 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HDGFL3Q9Y3E1 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HDGFL3Q9Y3E1 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HDGFL3Q9Y3E1 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HDGFL3Q9Y3E1 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HDGFL3Q9Y3E1 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HDGFL3Q9Y3E1 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HDGFL3Q9Y3E1 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HDGFL3Q9Y3E1 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HDGFL3Q9Y3E1 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HDGFL3Q9Y3E1 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HDGFL3Q9Y3E1 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HDGFL3Q9Y3E1 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HDGFL3Q9Y3E1 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HDGFL3Q9Y3E1 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HDGFL3Q9Y3E1 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HDGFL3Q9Y3E1 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HDGFL3Q9Y3E1 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HDGFL3Q9Y3E1 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HDGFL3Q9Y3E1 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HDGFL3Q9Y3E1 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HDGFL3Q9Y3E1 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HDGFL3Q9Y3E1 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HDGFL3Q9Y3E1 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HDGFL3Q9Y3E1 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HDGFL3Q9Y3E1 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HDGFL3Q9Y3E1 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HDGFL3Q9Y3E1 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HDGFL3Q9Y3E1 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HDGFL3Q9Y3E1 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HDGFL3Q9Y3E1 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HDGFL3Q9Y3E1 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HDGFL3Q9Y3E1 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HDGFL3Q9Y3E1 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HDGFL3Q9Y3E1 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HDGFL3Q9Y3E1 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HDGFL3Q9Y3E1 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
HDGFL3Q9Y3E1 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HDGFL3Q9Y3E1 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HDGFL3Q9Y3E1 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HDGFL3Q9Y3E1 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HDGFL3Q9Y3E1 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HDGFL3Q9Y3E1 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
HDGFL3Q9Y3E1 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HDGFL3Q9Y3E1 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HDGFL3Q9Y3E1 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HDGFL3Q9Y3E1 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HDGFL3Q9Y3E1 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HDGFL3Q9Y3E1 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HDGFL3Q9Y3E1 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HDGFL3Q9Y3E1 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HDGFL3Q9Y3E1 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HDGFL3Q9Y3E1 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HDGFL3Q9Y3E1 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HDGFL3Q9Y3E1 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HDGFL3Q9Y3E1 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HDGFL3Q9Y3E1 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HDGFL3Q9Y3E1 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
HDGFL3Q9Y3E1 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
HDGFL3Q9Y3E1 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
HDGFL3Q9Y3E1 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
HDGFL3Q9Y3E1 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HDGFL3Q9Y3E1 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HDGFL3Q9Y3E1 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
HDGFL3Q9Y3E1 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HDGFL3Q9Y3E1 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
HDGFL3Q9Y3E1 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HDGFL3Q9Y3E1 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HDGFL3Q9Y3E1 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HDGFL3Q9Y3E1 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HDGFL3Q9Y3E1 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HDGFL3Q9Y3E1 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
HDGFL3Q9Y3E1 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
HDGFL3Q9Y3E1 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
HDGFL3Q9Y3E1 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
HDGFL3Q9Y3E1 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
HDGFL3Q9Y3E1 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
HDGFL3Q9Y3E1 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
HDGFL3Q9Y3E1 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
HDGFL3Q9Y3E1 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HDGFL3Q9Y3E1 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HDGFL3Q9Y3E1 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
HDGFL3Q9Y3E1 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
HDGFL3Q9Y3E1 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HDGFL3Q9Y3E1 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HDGFL3Q9Y3E1 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
HDGFL3Q9Y3E1 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HDGFL3Q9Y3E1 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
HDGFL3Q9Y3E1 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HDGFL3Q9Y3E1 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
HDGFL3Q9Y3E1 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HDGFL3Q9Y3E1 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HDGFL3Q9Y3E1 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
HDGFL3Q9Y3E1 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
HDGFL3Q9Y3E1 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
HDGFL3Q9Y3E1 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
HDGFL3Q9Y3E1 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
HDGFL3Q9Y3E1 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms