Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y397

ZDHHC9, Palmitoyltransferase ZDHHC9, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZDHHC9Q9Y397 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZDHHC9Q9Y397 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZDHHC9Q9Y397 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
ZDHHC9Q9Y397 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZDHHC9Q9Y397 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZDHHC9Q9Y397 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZDHHC9Q9Y397 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZDHHC9Q9Y397 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZDHHC9Q9Y397 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZDHHC9Q9Y397 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZDHHC9Q9Y397 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZDHHC9Q9Y397 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZDHHC9Q9Y397 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZDHHC9Q9Y397 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZDHHC9Q9Y397 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZDHHC9Q9Y397 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZDHHC9Q9Y397 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZDHHC9Q9Y397 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZDHHC9Q9Y397 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZDHHC9Q9Y397 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZDHHC9Q9Y397 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZDHHC9Q9Y397 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZDHHC9Q9Y397 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
ZDHHC9Q9Y397 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZDHHC9Q9Y397 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZDHHC9Q9Y397 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZDHHC9Q9Y397 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZDHHC9Q9Y397 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZDHHC9Q9Y397 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZDHHC9Q9Y397 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZDHHC9Q9Y397 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZDHHC9Q9Y397 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZDHHC9Q9Y397 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZDHHC9Q9Y397 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZDHHC9Q9Y397 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZDHHC9Q9Y397 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZDHHC9Q9Y397 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZDHHC9Q9Y397 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZDHHC9Q9Y397 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZDHHC9Q9Y397 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZDHHC9Q9Y397 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZDHHC9Q9Y397 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZDHHC9Q9Y397 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZDHHC9Q9Y397 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZDHHC9Q9Y397 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZDHHC9Q9Y397 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZDHHC9Q9Y397 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZDHHC9Q9Y397 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZDHHC9Q9Y397 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZDHHC9Q9Y397 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZDHHC9Q9Y397 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZDHHC9Q9Y397 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZDHHC9Q9Y397 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ZDHHC9Q9Y397 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZDHHC9Q9Y397 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZDHHC9Q9Y397 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZDHHC9Q9Y397 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZDHHC9Q9Y397 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZDHHC9Q9Y397 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZDHHC9Q9Y397 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZDHHC9Q9Y397 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZDHHC9Q9Y397 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZDHHC9Q9Y397 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZDHHC9Q9Y397 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZDHHC9Q9Y397 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZDHHC9Q9Y397 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZDHHC9Q9Y397 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
ZDHHC9Q9Y397 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZDHHC9Q9Y397 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZDHHC9Q9Y397 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZDHHC9Q9Y397 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZDHHC9Q9Y397 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZDHHC9Q9Y397 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZDHHC9Q9Y397 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
ZDHHC9Q9Y397 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZDHHC9Q9Y397 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZDHHC9Q9Y397 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZDHHC9Q9Y397 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZDHHC9Q9Y397 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZDHHC9Q9Y397 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZDHHC9Q9Y397 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZDHHC9Q9Y397 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZDHHC9Q9Y397 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZDHHC9Q9Y397 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZDHHC9Q9Y397 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZDHHC9Q9Y397 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZDHHC9Q9Y397 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZDHHC9Q9Y397 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZDHHC9Q9Y397 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZDHHC9Q9Y397 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ZDHHC9Q9Y397 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
ZDHHC9Q9Y397 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
ZDHHC9Q9Y397 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ZDHHC9Q9Y397 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ZDHHC9Q9Y397 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
ZDHHC9Q9Y397 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ZDHHC9Q9Y397 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZDHHC9Q9Y397 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZDHHC9Q9Y397 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZDHHC9Q9Y397 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms