Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2N7

HIF3A, Hypoxia-inducible factor 3-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF3AQ9Y2N7 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HIF3AQ9Y2N7 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HIF3AQ9Y2N7 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HIF3AQ9Y2N7 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HIF3AQ9Y2N7 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HIF3AQ9Y2N7 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HIF3AQ9Y2N7 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HIF3AQ9Y2N7 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HIF3AQ9Y2N7 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
HIF3AQ9Y2N7 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HIF3AQ9Y2N7 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HIF3AQ9Y2N7 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HIF3AQ9Y2N7 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HIF3AQ9Y2N7 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HIF3AQ9Y2N7 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HIF3AQ9Y2N7 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HIF3AQ9Y2N7 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HIF3AQ9Y2N7 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HIF3AQ9Y2N7 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HIF3AQ9Y2N7 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HIF3AQ9Y2N7 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HIF3AQ9Y2N7 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HIF3AQ9Y2N7 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HIF3AQ9Y2N7 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HIF3AQ9Y2N7 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HIF3AQ9Y2N7 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HIF3AQ9Y2N7 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HIF3AQ9Y2N7 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HIF3AQ9Y2N7 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
HIF3AQ9Y2N7 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HIF3AQ9Y2N7 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HIF3AQ9Y2N7 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HIF3AQ9Y2N7 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HIF3AQ9Y2N7 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HIF3AQ9Y2N7 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HIF3AQ9Y2N7 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HIF3AQ9Y2N7 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HIF3AQ9Y2N7 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HIF3AQ9Y2N7 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
HIF3AQ9Y2N7 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HIF3AQ9Y2N7 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HIF3AQ9Y2N7 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HIF3AQ9Y2N7 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HIF3AQ9Y2N7 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HIF3AQ9Y2N7 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HIF3AQ9Y2N7 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HIF3AQ9Y2N7 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
HIF3AQ9Y2N7 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
HIF3AQ9Y2N7 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HIF3AQ9Y2N7 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HIF3AQ9Y2N7 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HIF3AQ9Y2N7 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HIF3AQ9Y2N7 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HIF3AQ9Y2N7 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HIF3AQ9Y2N7 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HIF3AQ9Y2N7 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HIF3AQ9Y2N7 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HIF3AQ9Y2N7 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HIF3AQ9Y2N7 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HIF3AQ9Y2N7 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HIF3AQ9Y2N7 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HIF3AQ9Y2N7 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HIF3AQ9Y2N7 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HIF3AQ9Y2N7 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HIF3AQ9Y2N7 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HIF3AQ9Y2N7 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HIF3AQ9Y2N7 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HIF3AQ9Y2N7 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HIF3AQ9Y2N7 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.58
HIF3AQ9Y2N7 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HIF3AQ9Y2N7 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HIF3AQ9Y2N7 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
HIF3AQ9Y2N7 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HIF3AQ9Y2N7 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HIF3AQ9Y2N7 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HIF3AQ9Y2N7 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HIF3AQ9Y2N7 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HIF3AQ9Y2N7 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HIF3AQ9Y2N7 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HIF3AQ9Y2N7 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HIF3AQ9Y2N7 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HIF3AQ9Y2N7 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HIF3AQ9Y2N7 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HIF3AQ9Y2N7 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HIF3AQ9Y2N7 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HIF3AQ9Y2N7 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
HIF3AQ9Y2N7 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HIF3AQ9Y2N7 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HIF3AQ9Y2N7 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HIF3AQ9Y2N7 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HIF3AQ9Y2N7 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HIF3AQ9Y2N7 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HIF3AQ9Y2N7 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HIF3AQ9Y2N7 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HIF3AQ9Y2N7 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
HIF3AQ9Y2N7 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HIF3AQ9Y2N7 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HIF3AQ9Y2N7 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HIF3AQ9Y2N7 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HIF3AQ9Y2N7 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.7 ms