Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K6

USP20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP20Q9Y2K6 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP20Q9Y2K6 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP20Q9Y2K6 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP20Q9Y2K6 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP20Q9Y2K6 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP20Q9Y2K6 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP20Q9Y2K6 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP20Q9Y2K6 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP20Q9Y2K6 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP20Q9Y2K6 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
USP20Q9Y2K6 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP20Q9Y2K6 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
USP20Q9Y2K6 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP20Q9Y2K6 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP20Q9Y2K6 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP20Q9Y2K6 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP20Q9Y2K6 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP20Q9Y2K6 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP20Q9Y2K6 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP20Q9Y2K6 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
USP20Q9Y2K6 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP20Q9Y2K6 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
USP20Q9Y2K6 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP20Q9Y2K6 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP20Q9Y2K6 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP20Q9Y2K6 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP20Q9Y2K6 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP20Q9Y2K6 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP20Q9Y2K6 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP20Q9Y2K6 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP20Q9Y2K6 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP20Q9Y2K6 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP20Q9Y2K6 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
USP20Q9Y2K6 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
USP20Q9Y2K6 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP20Q9Y2K6 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP20Q9Y2K6 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP20Q9Y2K6 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP20Q9Y2K6 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP20Q9Y2K6 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP20Q9Y2K6 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP20Q9Y2K6 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP20Q9Y2K6 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP20Q9Y2K6 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP20Q9Y2K6 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP20Q9Y2K6 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
USP20Q9Y2K6 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP20Q9Y2K6 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP20Q9Y2K6 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
USP20Q9Y2K6 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
USP20Q9Y2K6 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
USP20Q9Y2K6 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP20Q9Y2K6 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP20Q9Y2K6 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP20Q9Y2K6 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP20Q9Y2K6 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP20Q9Y2K6 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
USP20Q9Y2K6 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP20Q9Y2K6 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP20Q9Y2K6 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP20Q9Y2K6 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP20Q9Y2K6 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
USP20Q9Y2K6 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP20Q9Y2K6 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP20Q9Y2K6 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP20Q9Y2K6 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP20Q9Y2K6 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP20Q9Y2K6 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP20Q9Y2K6 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP20Q9Y2K6 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP20Q9Y2K6 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP20Q9Y2K6 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP20Q9Y2K6 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
USP20Q9Y2K6 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP20Q9Y2K6 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP20Q9Y2K6 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP20Q9Y2K6 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
USP20Q9Y2K6 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
USP20Q9Y2K6 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP20Q9Y2K6 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP20Q9Y2K6 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP20Q9Y2K6 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP20Q9Y2K6 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP20Q9Y2K6 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP20Q9Y2K6 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP20Q9Y2K6 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP20Q9Y2K6 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP20Q9Y2K6 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP20Q9Y2K6 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
USP20Q9Y2K6 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP20Q9Y2K6 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP20Q9Y2K6 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP20Q9Y2K6 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP20Q9Y2K6 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP20Q9Y2K6 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP20Q9Y2K6 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP20Q9Y2K6 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP20Q9Y2K6 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP20Q9Y2K6 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP20Q9Y2K6 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms