Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2E6

DTX4, E3 ubiquitin-protein ligase DTX4, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX4Q9Y2E6 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DTX4Q9Y2E6 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
DTX4Q9Y2E6 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
DTX4Q9Y2E6 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DTX4Q9Y2E6 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DTX4Q9Y2E6 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
DTX4Q9Y2E6 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
DTX4Q9Y2E6 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
DTX4Q9Y2E6 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
DTX4Q9Y2E6 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DTX4Q9Y2E6 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DTX4Q9Y2E6 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DTX4Q9Y2E6 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DTX4Q9Y2E6 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
DTX4Q9Y2E6 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
DTX4Q9Y2E6 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DTX4Q9Y2E6 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DTX4Q9Y2E6 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DTX4Q9Y2E6 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
DTX4Q9Y2E6 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
DTX4Q9Y2E6 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DTX4Q9Y2E6 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DTX4Q9Y2E6 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
DTX4Q9Y2E6 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
DTX4Q9Y2E6 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
DTX4Q9Y2E6 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
DTX4Q9Y2E6 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
DTX4Q9Y2E6 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DTX4Q9Y2E6 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DTX4Q9Y2E6 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
DTX4Q9Y2E6 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DTX4Q9Y2E6 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
DTX4Q9Y2E6 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
DTX4Q9Y2E6 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
DTX4Q9Y2E6 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
DTX4Q9Y2E6 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
DTX4Q9Y2E6 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
DTX4Q9Y2E6 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
DTX4Q9Y2E6 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
DTX4Q9Y2E6 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
DTX4Q9Y2E6 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
DTX4Q9Y2E6 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
DTX4Q9Y2E6 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
DTX4Q9Y2E6 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
DTX4Q9Y2E6 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
DTX4Q9Y2E6 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
DTX4Q9Y2E6 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
DTX4Q9Y2E6 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
DTX4Q9Y2E6 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
DTX4Q9Y2E6 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
DTX4Q9Y2E6 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
DTX4Q9Y2E6 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
DTX4Q9Y2E6 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
DTX4Q9Y2E6 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
DTX4Q9Y2E6 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
DTX4Q9Y2E6 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
DTX4Q9Y2E6 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
DTX4Q9Y2E6 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
DTX4Q9Y2E6 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
DTX4Q9Y2E6 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
DTX4Q9Y2E6 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
DTX4Q9Y2E6 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
DTX4Q9Y2E6 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
DTX4Q9Y2E6 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
DTX4Q9Y2E6 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
DTX4Q9Y2E6 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
DTX4Q9Y2E6 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
DTX4Q9Y2E6 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
DTX4Q9Y2E6 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
DTX4Q9Y2E6 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
DTX4Q9Y2E6 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
DTX4Q9Y2E6 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
DTX4Q9Y2E6 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
DTX4Q9Y2E6 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
DTX4Q9Y2E6 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
DTX4Q9Y2E6 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
DTX4Q9Y2E6 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
DTX4Q9Y2E6 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
DTX4Q9Y2E6 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
DTX4Q9Y2E6 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
DTX4Q9Y2E6 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
DTX4Q9Y2E6 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
DTX4Q9Y2E6 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
DTX4Q9Y2E6 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
DTX4Q9Y2E6 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
DTX4Q9Y2E6 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
DTX4Q9Y2E6 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
DTX4Q9Y2E6 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
DTX4Q9Y2E6 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
DTX4Q9Y2E6 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
DTX4Q9Y2E6 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
DTX4Q9Y2E6 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
DTX4Q9Y2E6 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
DTX4Q9Y2E6 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
DTX4Q9Y2E6 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
DTX4Q9Y2E6 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
DTX4Q9Y2E6 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
DTX4Q9Y2E6 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
DTX4Q9Y2E6 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
DTX4Q9Y2E6 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.7 ms