Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y259

CHKB, Choline/ethanolamine kinase, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHKBQ9Y259 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CHKBQ9Y259 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CHKBQ9Y259 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CHKBQ9Y259 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CHKBQ9Y259 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CHKBQ9Y259 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CHKBQ9Y259 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CHKBQ9Y259 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CHKBQ9Y259 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CHKBQ9Y259 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CHKBQ9Y259 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CHKBQ9Y259 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CHKBQ9Y259 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CHKBQ9Y259 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CHKBQ9Y259 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CHKBQ9Y259 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CHKBQ9Y259 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CHKBQ9Y259 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CHKBQ9Y259 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CHKBQ9Y259 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CHKBQ9Y259 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CHKBQ9Y259 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CHKBQ9Y259 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CHKBQ9Y259 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CHKBQ9Y259 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CHKBQ9Y259 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CHKBQ9Y259 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CHKBQ9Y259 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CHKBQ9Y259 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CHKBQ9Y259 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CHKBQ9Y259 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CHKBQ9Y259 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CHKBQ9Y259 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CHKBQ9Y259 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CHKBQ9Y259 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CHKBQ9Y259 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CHKBQ9Y259 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CHKBQ9Y259 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CHKBQ9Y259 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CHKBQ9Y259 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CHKBQ9Y259 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CHKBQ9Y259 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHKBQ9Y259 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHKBQ9Y259 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHKBQ9Y259 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHKBQ9Y259 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHKBQ9Y259 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
CHKBQ9Y259 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHKBQ9Y259 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CHKBQ9Y259 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHKBQ9Y259 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHKBQ9Y259 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CHKBQ9Y259 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHKBQ9Y259 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CHKBQ9Y259 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CHKBQ9Y259 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CHKBQ9Y259 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CHKBQ9Y259 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHKBQ9Y259 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CHKBQ9Y259 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CHKBQ9Y259 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHKBQ9Y259 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHKBQ9Y259 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CHKBQ9Y259 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CHKBQ9Y259 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CHKBQ9Y259 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CHKBQ9Y259 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CHKBQ9Y259 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CHKBQ9Y259 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CHKBQ9Y259 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CHKBQ9Y259 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CHKBQ9Y259 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CHKBQ9Y259 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
CHKBQ9Y259 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CHKBQ9Y259 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CHKBQ9Y259 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CHKBQ9Y259 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CHKBQ9Y259 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CHKBQ9Y259 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CHKBQ9Y259 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CHKBQ9Y259 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CHKBQ9Y259 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CHKBQ9Y259 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CHKBQ9Y259 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CHKBQ9Y259 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CHKBQ9Y259 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CHKBQ9Y259 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CHKBQ9Y259 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CHKBQ9Y259 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CHKBQ9Y259 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CHKBQ9Y259 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CHKBQ9Y259 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CHKBQ9Y259 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CHKBQ9Y259 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CHKBQ9Y259 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
CHKBQ9Y259 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CHKBQ9Y259 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
CHKBQ9Y259 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CHKBQ9Y259 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CHKBQ9Y259 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.4 ms