Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN81

L1RE1, LINE-1 retrotransposable element ORF1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1RE1Q9UN81 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
L1RE1Q9UN81 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
L1RE1Q9UN81 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
L1RE1Q9UN81 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
L1RE1Q9UN81 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
L1RE1Q9UN81 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
L1RE1Q9UN81 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
L1RE1Q9UN81 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
L1RE1Q9UN81 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
L1RE1Q9UN81 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
L1RE1Q9UN81 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
L1RE1Q9UN81 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
L1RE1Q9UN81 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
L1RE1Q9UN81 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
L1RE1Q9UN81 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
L1RE1Q9UN81 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
L1RE1Q9UN81 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
L1RE1Q9UN81 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
L1RE1Q9UN81 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
L1RE1Q9UN81 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
L1RE1Q9UN81 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
L1RE1Q9UN81 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
L1RE1Q9UN81 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
L1RE1Q9UN81 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
L1RE1Q9UN81 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
L1RE1Q9UN81 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
L1RE1Q9UN81 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
L1RE1Q9UN81 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
L1RE1Q9UN81 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
L1RE1Q9UN81 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
L1RE1Q9UN81 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
L1RE1Q9UN81 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
L1RE1Q9UN81 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
L1RE1Q9UN81 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
L1RE1Q9UN81 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
L1RE1Q9UN81 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
L1RE1Q9UN81 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
L1RE1Q9UN81 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
L1RE1Q9UN81 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
L1RE1Q9UN81 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
L1RE1Q9UN81 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
L1RE1Q9UN81 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
L1RE1Q9UN81 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
L1RE1Q9UN81 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
L1RE1Q9UN81 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
L1RE1Q9UN81 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
L1RE1Q9UN81 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
L1RE1Q9UN81 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
L1RE1Q9UN81 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
L1RE1Q9UN81 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
L1RE1Q9UN81 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
L1RE1Q9UN81 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
L1RE1Q9UN81 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
L1RE1Q9UN81 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
L1RE1Q9UN81 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
L1RE1Q9UN81 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
L1RE1Q9UN81 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
L1RE1Q9UN81 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
L1RE1Q9UN81 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
L1RE1Q9UN81 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
L1RE1Q9UN81 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
L1RE1Q9UN81 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
L1RE1Q9UN81 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
L1RE1Q9UN81 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
L1RE1Q9UN81 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
L1RE1Q9UN81 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
L1RE1Q9UN81 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
L1RE1Q9UN81 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
L1RE1Q9UN81 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
L1RE1Q9UN81 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
L1RE1Q9UN81 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
L1RE1Q9UN81 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
L1RE1Q9UN81 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
L1RE1Q9UN81 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
L1RE1Q9UN81 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
L1RE1Q9UN81 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
L1RE1Q9UN81 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
L1RE1Q9UN81 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
L1RE1Q9UN81 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
L1RE1Q9UN81 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
L1RE1Q9UN81 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
L1RE1Q9UN81 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
L1RE1Q9UN81 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
L1RE1Q9UN81 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
L1RE1Q9UN81 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
L1RE1Q9UN81 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
L1RE1Q9UN81 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
L1RE1Q9UN81 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
L1RE1Q9UN81 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
L1RE1Q9UN81 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
L1RE1Q9UN81 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
L1RE1Q9UN81 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
L1RE1Q9UN81 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
L1RE1Q9UN81 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
L1RE1Q9UN81 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
L1RE1Q9UN81 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
L1RE1Q9UN81 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
L1RE1Q9UN81 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
L1RE1Q9UN81 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
L1RE1Q9UN81 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms