Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMY4

SNX12, Sorting nexin-12, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX12Q9UMY4 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SNX12Q9UMY4 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SNX12Q9UMY4 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SNX12Q9UMY4 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SNX12Q9UMY4 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SNX12Q9UMY4 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SNX12Q9UMY4 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SNX12Q9UMY4 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SNX12Q9UMY4 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SNX12Q9UMY4 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNX12Q9UMY4 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNX12Q9UMY4 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNX12Q9UMY4 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNX12Q9UMY4 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNX12Q9UMY4 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNX12Q9UMY4 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNX12Q9UMY4 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNX12Q9UMY4 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNX12Q9UMY4 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNX12Q9UMY4 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNX12Q9UMY4 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNX12Q9UMY4 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNX12Q9UMY4 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNX12Q9UMY4 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNX12Q9UMY4 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNX12Q9UMY4 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNX12Q9UMY4 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNX12Q9UMY4 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNX12Q9UMY4 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNX12Q9UMY4 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SNX12Q9UMY4 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNX12Q9UMY4 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNX12Q9UMY4 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNX12Q9UMY4 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNX12Q9UMY4 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNX12Q9UMY4 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SNX12Q9UMY4 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNX12Q9UMY4 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNX12Q9UMY4 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNX12Q9UMY4 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNX12Q9UMY4 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNX12Q9UMY4 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNX12Q9UMY4 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNX12Q9UMY4 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNX12Q9UMY4 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNX12Q9UMY4 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNX12Q9UMY4 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNX12Q9UMY4 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNX12Q9UMY4 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNX12Q9UMY4 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNX12Q9UMY4 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNX12Q9UMY4 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNX12Q9UMY4 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNX12Q9UMY4 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNX12Q9UMY4 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNX12Q9UMY4 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNX12Q9UMY4 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNX12Q9UMY4 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNX12Q9UMY4 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNX12Q9UMY4 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNX12Q9UMY4 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNX12Q9UMY4 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNX12Q9UMY4 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNX12Q9UMY4 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNX12Q9UMY4 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNX12Q9UMY4 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNX12Q9UMY4 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNX12Q9UMY4 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNX12Q9UMY4 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNX12Q9UMY4 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNX12Q9UMY4 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNX12Q9UMY4 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNX12Q9UMY4 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNX12Q9UMY4 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNX12Q9UMY4 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNX12Q9UMY4 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNX12Q9UMY4 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNX12Q9UMY4 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNX12Q9UMY4 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNX12Q9UMY4 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNX12Q9UMY4 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNX12Q9UMY4 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNX12Q9UMY4 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SNX12Q9UMY4 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNX12Q9UMY4 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SNX12Q9UMY4 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SNX12Q9UMY4 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SNX12Q9UMY4 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SNX12Q9UMY4 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SNX12Q9UMY4 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SNX12Q9UMY4 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SNX12Q9UMY4 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SNX12Q9UMY4 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SNX12Q9UMY4 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNX12Q9UMY4 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SNX12Q9UMY4 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNX12Q9UMY4 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNX12Q9UMY4 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNX12Q9UMY4 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNX12Q9UMY4 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms