Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULM2

ZNF490, Zinc finger protein 490, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF490Q9ULM2 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF490Q9ULM2 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF490Q9ULM2 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF490Q9ULM2 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF490Q9ULM2 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF490Q9ULM2 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF490Q9ULM2 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF490Q9ULM2 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF490Q9ULM2 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF490Q9ULM2 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF490Q9ULM2 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF490Q9ULM2 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF490Q9ULM2 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF490Q9ULM2 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF490Q9ULM2 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF490Q9ULM2 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF490Q9ULM2 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF490Q9ULM2 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF490Q9ULM2 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF490Q9ULM2 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF490Q9ULM2 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF490Q9ULM2 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF490Q9ULM2 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF490Q9ULM2 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF490Q9ULM2 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF490Q9ULM2 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ZNF490Q9ULM2 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ZNF490Q9ULM2 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
ZNF490Q9ULM2 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF490Q9ULM2 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF490Q9ULM2 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF490Q9ULM2 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF490Q9ULM2 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF490Q9ULM2 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF490Q9ULM2 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF490Q9ULM2 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF490Q9ULM2 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF490Q9ULM2 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF490Q9ULM2 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF490Q9ULM2 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF490Q9ULM2 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF490Q9ULM2 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF490Q9ULM2 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF490Q9ULM2 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF490Q9ULM2 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF490Q9ULM2 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF490Q9ULM2 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF490Q9ULM2 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF490Q9ULM2 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF490Q9ULM2 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF490Q9ULM2 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF490Q9ULM2 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF490Q9ULM2 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF490Q9ULM2 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF490Q9ULM2 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF490Q9ULM2 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF490Q9ULM2 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF490Q9ULM2 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF490Q9ULM2 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF490Q9ULM2 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF490Q9ULM2 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF490Q9ULM2 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF490Q9ULM2 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF490Q9ULM2 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF490Q9ULM2 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF490Q9ULM2 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF490Q9ULM2 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF490Q9ULM2 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF490Q9ULM2 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF490Q9ULM2 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF490Q9ULM2 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF490Q9ULM2 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF490Q9ULM2 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF490Q9ULM2 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF490Q9ULM2 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF490Q9ULM2 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF490Q9ULM2 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF490Q9ULM2 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF490Q9ULM2 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF490Q9ULM2 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF490Q9ULM2 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF490Q9ULM2 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF490Q9ULM2 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF490Q9ULM2 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF490Q9ULM2 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF490Q9ULM2 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF490Q9ULM2 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF490Q9ULM2 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF490Q9ULM2 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF490Q9ULM2 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF490Q9ULM2 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF490Q9ULM2 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF490Q9ULM2 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF490Q9ULM2 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF490Q9ULM2 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF490Q9ULM2 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF490Q9ULM2 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF490Q9ULM2 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF490Q9ULM2 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF490Q9ULM2 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms