Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD4

BRPF3, Bromodomain and PHD finger-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF3Q9ULD4 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
BRPF3Q9ULD4 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
BRPF3Q9ULD4 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
BRPF3Q9ULD4 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
BRPF3Q9ULD4 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
BRPF3Q9ULD4 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
BRPF3Q9ULD4 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
BRPF3Q9ULD4 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
BRPF3Q9ULD4 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
BRPF3Q9ULD4 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
BRPF3Q9ULD4 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
BRPF3Q9ULD4 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
BRPF3Q9ULD4 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
BRPF3Q9ULD4 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
BRPF3Q9ULD4 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
BRPF3Q9ULD4 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
BRPF3Q9ULD4 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
BRPF3Q9ULD4 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
BRPF3Q9ULD4 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
BRPF3Q9ULD4 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
BRPF3Q9ULD4 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
BRPF3Q9ULD4 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
BRPF3Q9ULD4 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
BRPF3Q9ULD4 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
BRPF3Q9ULD4 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
BRPF3Q9ULD4 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
BRPF3Q9ULD4 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
BRPF3Q9ULD4 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
BRPF3Q9ULD4 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
BRPF3Q9ULD4 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
BRPF3Q9ULD4 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
BRPF3Q9ULD4 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
BRPF3Q9ULD4 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
BRPF3Q9ULD4 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
BRPF3Q9ULD4 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
BRPF3Q9ULD4 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BRPF3Q9ULD4 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
BRPF3Q9ULD4 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
BRPF3Q9ULD4 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BRPF3Q9ULD4 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BRPF3Q9ULD4 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
BRPF3Q9ULD4 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
BRPF3Q9ULD4 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
BRPF3Q9ULD4 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
BRPF3Q9ULD4 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
BRPF3Q9ULD4 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
BRPF3Q9ULD4 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BRPF3Q9ULD4 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
BRPF3Q9ULD4 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BRPF3Q9ULD4 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BRPF3Q9ULD4 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BRPF3Q9ULD4 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BRPF3Q9ULD4 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
BRPF3Q9ULD4 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BRPF3Q9ULD4 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
BRPF3Q9ULD4 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
BRPF3Q9ULD4 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
BRPF3Q9ULD4 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
BRPF3Q9ULD4 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
BRPF3Q9ULD4 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
BRPF3Q9ULD4 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
BRPF3Q9ULD4 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
BRPF3Q9ULD4 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
BRPF3Q9ULD4 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
BRPF3Q9ULD4 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
BRPF3Q9ULD4 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
BRPF3Q9ULD4 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
BRPF3Q9ULD4 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
BRPF3Q9ULD4 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
BRPF3Q9ULD4 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
BRPF3Q9ULD4 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
BRPF3Q9ULD4 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
BRPF3Q9ULD4 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
BRPF3Q9ULD4 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
BRPF3Q9ULD4 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
BRPF3Q9ULD4 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
BRPF3Q9ULD4 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
BRPF3Q9ULD4 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
BRPF3Q9ULD4 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
BRPF3Q9ULD4 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
BRPF3Q9ULD4 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
BRPF3Q9ULD4 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
BRPF3Q9ULD4 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
BRPF3Q9ULD4 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
BRPF3Q9ULD4 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
BRPF3Q9ULD4 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
BRPF3Q9ULD4 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
BRPF3Q9ULD4 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
BRPF3Q9ULD4 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
BRPF3Q9ULD4 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
BRPF3Q9ULD4 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
BRPF3Q9ULD4 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
BRPF3Q9ULD4 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
BRPF3Q9ULD4 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
BRPF3Q9ULD4 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
BRPF3Q9ULD4 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
BRPF3Q9ULD4 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
BRPF3Q9ULD4 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
BRPF3Q9ULD4 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
BRPF3Q9ULD4 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms