Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ68

MSRA, Mitochondrial peptide methionine sulfoxide reductase, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSRAQ9UJ68 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MSRAQ9UJ68 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MSRAQ9UJ68 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MSRAQ9UJ68 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MSRAQ9UJ68 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MSRAQ9UJ68 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MSRAQ9UJ68 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MSRAQ9UJ68 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MSRAQ9UJ68 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
MSRAQ9UJ68 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MSRAQ9UJ68 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MSRAQ9UJ68 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
MSRAQ9UJ68 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MSRAQ9UJ68 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MSRAQ9UJ68 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MSRAQ9UJ68 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MSRAQ9UJ68 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MSRAQ9UJ68 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MSRAQ9UJ68 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MSRAQ9UJ68 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MSRAQ9UJ68 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MSRAQ9UJ68 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MSRAQ9UJ68 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MSRAQ9UJ68 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MSRAQ9UJ68 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MSRAQ9UJ68 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MSRAQ9UJ68 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MSRAQ9UJ68 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MSRAQ9UJ68 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MSRAQ9UJ68 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MSRAQ9UJ68 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MSRAQ9UJ68 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MSRAQ9UJ68 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MSRAQ9UJ68 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MSRAQ9UJ68 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MSRAQ9UJ68 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MSRAQ9UJ68 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MSRAQ9UJ68 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MSRAQ9UJ68 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MSRAQ9UJ68 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MSRAQ9UJ68 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MSRAQ9UJ68 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MSRAQ9UJ68 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MSRAQ9UJ68 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MSRAQ9UJ68 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MSRAQ9UJ68 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MSRAQ9UJ68 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MSRAQ9UJ68 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MSRAQ9UJ68 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MSRAQ9UJ68 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MSRAQ9UJ68 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MSRAQ9UJ68 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MSRAQ9UJ68 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
MSRAQ9UJ68 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MSRAQ9UJ68 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MSRAQ9UJ68 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MSRAQ9UJ68 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MSRAQ9UJ68 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MSRAQ9UJ68 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MSRAQ9UJ68 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MSRAQ9UJ68 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MSRAQ9UJ68 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MSRAQ9UJ68 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MSRAQ9UJ68 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MSRAQ9UJ68 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MSRAQ9UJ68 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MSRAQ9UJ68 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MSRAQ9UJ68 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MSRAQ9UJ68 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MSRAQ9UJ68 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MSRAQ9UJ68 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MSRAQ9UJ68 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
MSRAQ9UJ68 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MSRAQ9UJ68 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MSRAQ9UJ68 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MSRAQ9UJ68 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MSRAQ9UJ68 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MSRAQ9UJ68 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MSRAQ9UJ68 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MSRAQ9UJ68 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MSRAQ9UJ68 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
MSRAQ9UJ68 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MSRAQ9UJ68 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MSRAQ9UJ68 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MSRAQ9UJ68 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MSRAQ9UJ68 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MSRAQ9UJ68 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MSRAQ9UJ68 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MSRAQ9UJ68 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MSRAQ9UJ68 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MSRAQ9UJ68 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MSRAQ9UJ68 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MSRAQ9UJ68 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MSRAQ9UJ68 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
MSRAQ9UJ68 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MSRAQ9UJ68 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MSRAQ9UJ68 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MSRAQ9UJ68 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MSRAQ9UJ68 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MSRAQ9UJ68 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms