Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

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Length 708 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1Q9UJ41 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RABGEF1Q9UJ41 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RABGEF1Q9UJ41 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RABGEF1Q9UJ41 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RABGEF1Q9UJ41 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RABGEF1Q9UJ41 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RABGEF1Q9UJ41 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RABGEF1Q9UJ41 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RABGEF1Q9UJ41 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RABGEF1Q9UJ41 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
RABGEF1Q9UJ41 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RABGEF1Q9UJ41 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RABGEF1Q9UJ41 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RABGEF1Q9UJ41 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RABGEF1Q9UJ41 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RABGEF1Q9UJ41 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RABGEF1Q9UJ41 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.29■■□□□ 1
RABGEF1Q9UJ41 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RABGEF1Q9UJ41 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RABGEF1Q9UJ41 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RABGEF1Q9UJ41 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RABGEF1Q9UJ41 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RABGEF1Q9UJ41 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RABGEF1Q9UJ41 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RABGEF1Q9UJ41 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RABGEF1Q9UJ41 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RABGEF1Q9UJ41 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RABGEF1Q9UJ41 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RABGEF1Q9UJ41 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RABGEF1Q9UJ41 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RABGEF1Q9UJ41 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RABGEF1Q9UJ41 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RABGEF1Q9UJ41 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RABGEF1Q9UJ41 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.28■■□□□ 1
RABGEF1Q9UJ41 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.28■■□□□ 1
RABGEF1Q9UJ41 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RABGEF1Q9UJ41 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RABGEF1Q9UJ41 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RABGEF1Q9UJ41 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RABGEF1Q9UJ41 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RABGEF1Q9UJ41 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RABGEF1Q9UJ41 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RABGEF1Q9UJ41 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RABGEF1Q9UJ41 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RABGEF1Q9UJ41 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
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RABGEF1Q9UJ41 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RABGEF1Q9UJ41 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RABGEF1Q9UJ41 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RABGEF1Q9UJ41 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RABGEF1Q9UJ41 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
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RABGEF1Q9UJ41 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
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RABGEF1Q9UJ41 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
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RABGEF1Q9UJ41 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
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RABGEF1Q9UJ41 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
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RABGEF1Q9UJ41 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
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RABGEF1Q9UJ41 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RABGEF1Q9UJ41 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RABGEF1Q9UJ41 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RABGEF1Q9UJ41 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
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RABGEF1Q9UJ41 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RABGEF1Q9UJ41 AC079416.2-201ENST00000625035 1193 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
RABGEF1Q9UJ41 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RABGEF1Q9UJ41 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RABGEF1Q9UJ41 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RABGEF1Q9UJ41 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RABGEF1Q9UJ41 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RABGEF1Q9UJ41 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RABGEF1Q9UJ41 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RABGEF1Q9UJ41 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RABGEF1Q9UJ41 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
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