Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHP3

USP25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, humanhuman

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Length 1,055 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25Q9UHP3 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
USP25Q9UHP3 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
USP25Q9UHP3 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
USP25Q9UHP3 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
USP25Q9UHP3 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
USP25Q9UHP3 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
USP25Q9UHP3 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
USP25Q9UHP3 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP25Q9UHP3 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP25Q9UHP3 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP25Q9UHP3 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP25Q9UHP3 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP25Q9UHP3 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP25Q9UHP3 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
USP25Q9UHP3 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP25Q9UHP3 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP25Q9UHP3 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP25Q9UHP3 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP25Q9UHP3 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP25Q9UHP3 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP25Q9UHP3 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP25Q9UHP3 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP25Q9UHP3 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP25Q9UHP3 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP25Q9UHP3 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP25Q9UHP3 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP25Q9UHP3 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP25Q9UHP3 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP25Q9UHP3 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP25Q9UHP3 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP25Q9UHP3 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP25Q9UHP3 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
USP25Q9UHP3 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
USP25Q9UHP3 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
USP25Q9UHP3 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP25Q9UHP3 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP25Q9UHP3 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP25Q9UHP3 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP25Q9UHP3 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP25Q9UHP3 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP25Q9UHP3 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP25Q9UHP3 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP25Q9UHP3 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP25Q9UHP3 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP25Q9UHP3 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP25Q9UHP3 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP25Q9UHP3 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP25Q9UHP3 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP25Q9UHP3 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP25Q9UHP3 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP25Q9UHP3 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP25Q9UHP3 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP25Q9UHP3 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
USP25Q9UHP3 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP25Q9UHP3 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP25Q9UHP3 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP25Q9UHP3 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP25Q9UHP3 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP25Q9UHP3 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
USP25Q9UHP3 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP25Q9UHP3 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP25Q9UHP3 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP25Q9UHP3 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP25Q9UHP3 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP25Q9UHP3 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP25Q9UHP3 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP25Q9UHP3 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP25Q9UHP3 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP25Q9UHP3 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP25Q9UHP3 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP25Q9UHP3 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP25Q9UHP3 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP25Q9UHP3 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP25Q9UHP3 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP25Q9UHP3 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
USP25Q9UHP3 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP25Q9UHP3 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP25Q9UHP3 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP25Q9UHP3 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP25Q9UHP3 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP25Q9UHP3 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP25Q9UHP3 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP25Q9UHP3 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP25Q9UHP3 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP25Q9UHP3 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP25Q9UHP3 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP25Q9UHP3 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP25Q9UHP3 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP25Q9UHP3 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP25Q9UHP3 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP25Q9UHP3 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP25Q9UHP3 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP25Q9UHP3 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP25Q9UHP3 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP25Q9UHP3 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP25Q9UHP3 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP25Q9UHP3 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP25Q9UHP3 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP25Q9UHP3 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP25Q9UHP3 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
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