Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHG0

DCDC2, Doublecortin domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCDC2Q9UHG0 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
DCDC2Q9UHG0 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
DCDC2Q9UHG0 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
DCDC2Q9UHG0 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
DCDC2Q9UHG0 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
DCDC2Q9UHG0 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
DCDC2Q9UHG0 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
DCDC2Q9UHG0 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
DCDC2Q9UHG0 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
DCDC2Q9UHG0 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
DCDC2Q9UHG0 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
DCDC2Q9UHG0 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
DCDC2Q9UHG0 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
DCDC2Q9UHG0 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
DCDC2Q9UHG0 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
DCDC2Q9UHG0 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
DCDC2Q9UHG0 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
DCDC2Q9UHG0 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
DCDC2Q9UHG0 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
DCDC2Q9UHG0 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
DCDC2Q9UHG0 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DCDC2Q9UHG0 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
DCDC2Q9UHG0 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DCDC2Q9UHG0 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
DCDC2Q9UHG0 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
DCDC2Q9UHG0 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DCDC2Q9UHG0 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DCDC2Q9UHG0 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
DCDC2Q9UHG0 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DCDC2Q9UHG0 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DCDC2Q9UHG0 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DCDC2Q9UHG0 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DCDC2Q9UHG0 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DCDC2Q9UHG0 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
DCDC2Q9UHG0 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DCDC2Q9UHG0 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
DCDC2Q9UHG0 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DCDC2Q9UHG0 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
DCDC2Q9UHG0 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DCDC2Q9UHG0 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
DCDC2Q9UHG0 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
DCDC2Q9UHG0 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DCDC2Q9UHG0 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
DCDC2Q9UHG0 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DCDC2Q9UHG0 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DCDC2Q9UHG0 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DCDC2Q9UHG0 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DCDC2Q9UHG0 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DCDC2Q9UHG0 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
DCDC2Q9UHG0 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
DCDC2Q9UHG0 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
DCDC2Q9UHG0 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DCDC2Q9UHG0 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DCDC2Q9UHG0 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
DCDC2Q9UHG0 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
DCDC2Q9UHG0 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
DCDC2Q9UHG0 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DCDC2Q9UHG0 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
DCDC2Q9UHG0 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DCDC2Q9UHG0 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
DCDC2Q9UHG0 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
DCDC2Q9UHG0 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
DCDC2Q9UHG0 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DCDC2Q9UHG0 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
DCDC2Q9UHG0 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DCDC2Q9UHG0 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
DCDC2Q9UHG0 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
DCDC2Q9UHG0 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
DCDC2Q9UHG0 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
DCDC2Q9UHG0 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DCDC2Q9UHG0 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DCDC2Q9UHG0 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
DCDC2Q9UHG0 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DCDC2Q9UHG0 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
DCDC2Q9UHG0 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DCDC2Q9UHG0 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
DCDC2Q9UHG0 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DCDC2Q9UHG0 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DCDC2Q9UHG0 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DCDC2Q9UHG0 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DCDC2Q9UHG0 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DCDC2Q9UHG0 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DCDC2Q9UHG0 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
DCDC2Q9UHG0 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
DCDC2Q9UHG0 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
DCDC2Q9UHG0 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
DCDC2Q9UHG0 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
DCDC2Q9UHG0 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
DCDC2Q9UHG0 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
DCDC2Q9UHG0 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
DCDC2Q9UHG0 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
DCDC2Q9UHG0 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
DCDC2Q9UHG0 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
DCDC2Q9UHG0 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
DCDC2Q9UHG0 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
DCDC2Q9UHG0 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
DCDC2Q9UHG0 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
DCDC2Q9UHG0 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
DCDC2Q9UHG0 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
DCDC2Q9UHG0 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms