Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHD1

CHORDC1, Cysteine and histidine-rich domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHORDC1Q9UHD1 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHORDC1Q9UHD1 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHORDC1Q9UHD1 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHORDC1Q9UHD1 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHORDC1Q9UHD1 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHORDC1Q9UHD1 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHORDC1Q9UHD1 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHORDC1Q9UHD1 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHORDC1Q9UHD1 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHORDC1Q9UHD1 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHORDC1Q9UHD1 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHORDC1Q9UHD1 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHORDC1Q9UHD1 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHORDC1Q9UHD1 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHORDC1Q9UHD1 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHORDC1Q9UHD1 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHORDC1Q9UHD1 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHORDC1Q9UHD1 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHORDC1Q9UHD1 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHORDC1Q9UHD1 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHORDC1Q9UHD1 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHORDC1Q9UHD1 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHORDC1Q9UHD1 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHORDC1Q9UHD1 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHORDC1Q9UHD1 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHORDC1Q9UHD1 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHORDC1Q9UHD1 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHORDC1Q9UHD1 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHORDC1Q9UHD1 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHORDC1Q9UHD1 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHORDC1Q9UHD1 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHORDC1Q9UHD1 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHORDC1Q9UHD1 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHORDC1Q9UHD1 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHORDC1Q9UHD1 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHORDC1Q9UHD1 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHORDC1Q9UHD1 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHORDC1Q9UHD1 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHORDC1Q9UHD1 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHORDC1Q9UHD1 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHORDC1Q9UHD1 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CHORDC1Q9UHD1 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CHORDC1Q9UHD1 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CHORDC1Q9UHD1 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHORDC1Q9UHD1 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHORDC1Q9UHD1 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CHORDC1Q9UHD1 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHORDC1Q9UHD1 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CHORDC1Q9UHD1 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHORDC1Q9UHD1 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHORDC1Q9UHD1 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHORDC1Q9UHD1 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CHORDC1Q9UHD1 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHORDC1Q9UHD1 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CHORDC1Q9UHD1 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CHORDC1Q9UHD1 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHORDC1Q9UHD1 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHORDC1Q9UHD1 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHORDC1Q9UHD1 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CHORDC1Q9UHD1 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHORDC1Q9UHD1 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHORDC1Q9UHD1 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHORDC1Q9UHD1 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHORDC1Q9UHD1 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHORDC1Q9UHD1 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHORDC1Q9UHD1 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHORDC1Q9UHD1 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHORDC1Q9UHD1 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHORDC1Q9UHD1 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHORDC1Q9UHD1 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHORDC1Q9UHD1 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHORDC1Q9UHD1 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHORDC1Q9UHD1 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CHORDC1Q9UHD1 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CHORDC1Q9UHD1 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHORDC1Q9UHD1 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHORDC1Q9UHD1 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHORDC1Q9UHD1 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHORDC1Q9UHD1 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHORDC1Q9UHD1 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHORDC1Q9UHD1 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHORDC1Q9UHD1 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHORDC1Q9UHD1 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHORDC1Q9UHD1 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHORDC1Q9UHD1 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHORDC1Q9UHD1 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHORDC1Q9UHD1 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHORDC1Q9UHD1 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHORDC1Q9UHD1 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHORDC1Q9UHD1 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHORDC1Q9UHD1 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHORDC1Q9UHD1 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHORDC1Q9UHD1 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHORDC1Q9UHD1 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHORDC1Q9UHD1 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHORDC1Q9UHD1 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHORDC1Q9UHD1 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHORDC1Q9UHD1 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHORDC1Q9UHD1 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHORDC1Q9UHD1 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms