Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH90

FBXO40, F-box only protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO40Q9UH90 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FBXO40Q9UH90 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FBXO40Q9UH90 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FBXO40Q9UH90 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FBXO40Q9UH90 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FBXO40Q9UH90 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
FBXO40Q9UH90 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
FBXO40Q9UH90 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FBXO40Q9UH90 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
FBXO40Q9UH90 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FBXO40Q9UH90 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FBXO40Q9UH90 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FBXO40Q9UH90 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FBXO40Q9UH90 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FBXO40Q9UH90 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FBXO40Q9UH90 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FBXO40Q9UH90 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FBXO40Q9UH90 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FBXO40Q9UH90 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FBXO40Q9UH90 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FBXO40Q9UH90 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FBXO40Q9UH90 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FBXO40Q9UH90 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FBXO40Q9UH90 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FBXO40Q9UH90 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FBXO40Q9UH90 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FBXO40Q9UH90 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FBXO40Q9UH90 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FBXO40Q9UH90 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FBXO40Q9UH90 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FBXO40Q9UH90 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FBXO40Q9UH90 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FBXO40Q9UH90 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FBXO40Q9UH90 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
FBXO40Q9UH90 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
FBXO40Q9UH90 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FBXO40Q9UH90 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FBXO40Q9UH90 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FBXO40Q9UH90 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
FBXO40Q9UH90 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FBXO40Q9UH90 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FBXO40Q9UH90 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FBXO40Q9UH90 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FBXO40Q9UH90 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FBXO40Q9UH90 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
FBXO40Q9UH90 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FBXO40Q9UH90 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FBXO40Q9UH90 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FBXO40Q9UH90 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FBXO40Q9UH90 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FBXO40Q9UH90 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
FBXO40Q9UH90 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FBXO40Q9UH90 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FBXO40Q9UH90 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FBXO40Q9UH90 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FBXO40Q9UH90 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FBXO40Q9UH90 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FBXO40Q9UH90 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FBXO40Q9UH90 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
FBXO40Q9UH90 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FBXO40Q9UH90 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FBXO40Q9UH90 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FBXO40Q9UH90 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FBXO40Q9UH90 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FBXO40Q9UH90 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FBXO40Q9UH90 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FBXO40Q9UH90 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FBXO40Q9UH90 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FBXO40Q9UH90 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FBXO40Q9UH90 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FBXO40Q9UH90 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FBXO40Q9UH90 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FBXO40Q9UH90 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FBXO40Q9UH90 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FBXO40Q9UH90 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FBXO40Q9UH90 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FBXO40Q9UH90 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FBXO40Q9UH90 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FBXO40Q9UH90 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FBXO40Q9UH90 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FBXO40Q9UH90 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
FBXO40Q9UH90 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FBXO40Q9UH90 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FBXO40Q9UH90 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FBXO40Q9UH90 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FBXO40Q9UH90 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FBXO40Q9UH90 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FBXO40Q9UH90 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FBXO40Q9UH90 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FBXO40Q9UH90 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FBXO40Q9UH90 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FBXO40Q9UH90 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FBXO40Q9UH90 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FBXO40Q9UH90 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FBXO40Q9UH90 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FBXO40Q9UH90 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FBXO40Q9UH90 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FBXO40Q9UH90 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FBXO40Q9UH90 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FBXO40Q9UH90 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms