Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT6

POLK, DNA polymerase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLKQ9UBT6 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
POLKQ9UBT6 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
POLKQ9UBT6 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
POLKQ9UBT6 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
POLKQ9UBT6 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
POLKQ9UBT6 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
POLKQ9UBT6 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC27.9■■■□□ 2.06
POLKQ9UBT6 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
POLKQ9UBT6 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
POLKQ9UBT6 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
POLKQ9UBT6 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
POLKQ9UBT6 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
POLKQ9UBT6 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
POLKQ9UBT6 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
POLKQ9UBT6 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
POLKQ9UBT6 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
POLKQ9UBT6 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
POLKQ9UBT6 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
POLKQ9UBT6 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
POLKQ9UBT6 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
POLKQ9UBT6 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
POLKQ9UBT6 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
POLKQ9UBT6 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
POLKQ9UBT6 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
POLKQ9UBT6 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
POLKQ9UBT6 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
POLKQ9UBT6 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
POLKQ9UBT6 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
POLKQ9UBT6 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
POLKQ9UBT6 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
POLKQ9UBT6 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
POLKQ9UBT6 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.05
POLKQ9UBT6 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
POLKQ9UBT6 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
POLKQ9UBT6 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
POLKQ9UBT6 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
POLKQ9UBT6 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
POLKQ9UBT6 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
POLKQ9UBT6 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
POLKQ9UBT6 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
POLKQ9UBT6 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
POLKQ9UBT6 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
POLKQ9UBT6 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
POLKQ9UBT6 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
POLKQ9UBT6 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
POLKQ9UBT6 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
POLKQ9UBT6 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
POLKQ9UBT6 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
POLKQ9UBT6 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
POLKQ9UBT6 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
POLKQ9UBT6 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
POLKQ9UBT6 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
POLKQ9UBT6 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
POLKQ9UBT6 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
POLKQ9UBT6 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
POLKQ9UBT6 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
POLKQ9UBT6 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
POLKQ9UBT6 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
POLKQ9UBT6 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
POLKQ9UBT6 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
POLKQ9UBT6 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
POLKQ9UBT6 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
POLKQ9UBT6 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
POLKQ9UBT6 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
POLKQ9UBT6 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
POLKQ9UBT6 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
POLKQ9UBT6 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
POLKQ9UBT6 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
POLKQ9UBT6 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
POLKQ9UBT6 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
POLKQ9UBT6 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
POLKQ9UBT6 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
POLKQ9UBT6 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
POLKQ9UBT6 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
POLKQ9UBT6 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
POLKQ9UBT6 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
POLKQ9UBT6 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
POLKQ9UBT6 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
POLKQ9UBT6 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
POLKQ9UBT6 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
POLKQ9UBT6 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
POLKQ9UBT6 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
POLKQ9UBT6 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
POLKQ9UBT6 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
POLKQ9UBT6 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
POLKQ9UBT6 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
POLKQ9UBT6 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
POLKQ9UBT6 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
POLKQ9UBT6 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
POLKQ9UBT6 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
POLKQ9UBT6 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
POLKQ9UBT6 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
POLKQ9UBT6 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
POLKQ9UBT6 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
POLKQ9UBT6 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
POLKQ9UBT6 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
POLKQ9UBT6 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
POLKQ9UBT6 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
POLKQ9UBT6 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
POLKQ9UBT6 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms