Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT3

DKK4, Dickkopf-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK4Q9UBT3 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
DKK4Q9UBT3 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
DKK4Q9UBT3 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
DKK4Q9UBT3 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
DKK4Q9UBT3 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
DKK4Q9UBT3 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
DKK4Q9UBT3 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
DKK4Q9UBT3 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
DKK4Q9UBT3 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
DKK4Q9UBT3 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
DKK4Q9UBT3 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
DKK4Q9UBT3 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
DKK4Q9UBT3 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
DKK4Q9UBT3 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
DKK4Q9UBT3 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
DKK4Q9UBT3 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
DKK4Q9UBT3 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
DKK4Q9UBT3 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
DKK4Q9UBT3 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
DKK4Q9UBT3 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
DKK4Q9UBT3 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
DKK4Q9UBT3 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
DKK4Q9UBT3 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
DKK4Q9UBT3 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
DKK4Q9UBT3 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
DKK4Q9UBT3 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
DKK4Q9UBT3 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
DKK4Q9UBT3 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
DKK4Q9UBT3 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
DKK4Q9UBT3 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
DKK4Q9UBT3 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
DKK4Q9UBT3 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
DKK4Q9UBT3 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
DKK4Q9UBT3 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
DKK4Q9UBT3 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
DKK4Q9UBT3 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
DKK4Q9UBT3 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
DKK4Q9UBT3 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
DKK4Q9UBT3 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
DKK4Q9UBT3 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
DKK4Q9UBT3 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
DKK4Q9UBT3 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
DKK4Q9UBT3 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
DKK4Q9UBT3 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
DKK4Q9UBT3 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
DKK4Q9UBT3 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
DKK4Q9UBT3 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
DKK4Q9UBT3 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
DKK4Q9UBT3 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
DKK4Q9UBT3 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
DKK4Q9UBT3 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
DKK4Q9UBT3 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
DKK4Q9UBT3 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
DKK4Q9UBT3 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
DKK4Q9UBT3 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
DKK4Q9UBT3 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
DKK4Q9UBT3 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
DKK4Q9UBT3 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
DKK4Q9UBT3 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
DKK4Q9UBT3 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DKK4Q9UBT3 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DKK4Q9UBT3 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DKK4Q9UBT3 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DKK4Q9UBT3 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DKK4Q9UBT3 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DKK4Q9UBT3 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
DKK4Q9UBT3 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
DKK4Q9UBT3 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
DKK4Q9UBT3 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
DKK4Q9UBT3 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
DKK4Q9UBT3 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
DKK4Q9UBT3 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
DKK4Q9UBT3 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
DKK4Q9UBT3 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
DKK4Q9UBT3 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
DKK4Q9UBT3 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DKK4Q9UBT3 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DKK4Q9UBT3 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DKK4Q9UBT3 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DKK4Q9UBT3 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
DKK4Q9UBT3 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DKK4Q9UBT3 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DKK4Q9UBT3 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DKK4Q9UBT3 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
DKK4Q9UBT3 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
DKK4Q9UBT3 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
DKK4Q9UBT3 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
DKK4Q9UBT3 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
DKK4Q9UBT3 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
DKK4Q9UBT3 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
DKK4Q9UBT3 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
DKK4Q9UBT3 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
DKK4Q9UBT3 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
DKK4Q9UBT3 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
DKK4Q9UBT3 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
DKK4Q9UBT3 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
DKK4Q9UBT3 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
DKK4Q9UBT3 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
DKK4Q9UBT3 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
DKK4Q9UBT3 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms