Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZI7

UBP1, Upstream-binding protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBP1Q9NZI7 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
UBP1Q9NZI7 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
UBP1Q9NZI7 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
UBP1Q9NZI7 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
UBP1Q9NZI7 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
UBP1Q9NZI7 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
UBP1Q9NZI7 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
UBP1Q9NZI7 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
UBP1Q9NZI7 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
UBP1Q9NZI7 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
UBP1Q9NZI7 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
UBP1Q9NZI7 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
UBP1Q9NZI7 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
UBP1Q9NZI7 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
UBP1Q9NZI7 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
UBP1Q9NZI7 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
UBP1Q9NZI7 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
UBP1Q9NZI7 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
UBP1Q9NZI7 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
UBP1Q9NZI7 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
UBP1Q9NZI7 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
UBP1Q9NZI7 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
UBP1Q9NZI7 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
UBP1Q9NZI7 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
UBP1Q9NZI7 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
UBP1Q9NZI7 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
UBP1Q9NZI7 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
UBP1Q9NZI7 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
UBP1Q9NZI7 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
UBP1Q9NZI7 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
UBP1Q9NZI7 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
UBP1Q9NZI7 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
UBP1Q9NZI7 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
UBP1Q9NZI7 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
UBP1Q9NZI7 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
UBP1Q9NZI7 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
UBP1Q9NZI7 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
UBP1Q9NZI7 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
UBP1Q9NZI7 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
UBP1Q9NZI7 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
UBP1Q9NZI7 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
UBP1Q9NZI7 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
UBP1Q9NZI7 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
UBP1Q9NZI7 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
UBP1Q9NZI7 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
UBP1Q9NZI7 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
UBP1Q9NZI7 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
UBP1Q9NZI7 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
UBP1Q9NZI7 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
UBP1Q9NZI7 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
UBP1Q9NZI7 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
UBP1Q9NZI7 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
UBP1Q9NZI7 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
UBP1Q9NZI7 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
UBP1Q9NZI7 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
UBP1Q9NZI7 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
UBP1Q9NZI7 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
UBP1Q9NZI7 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
UBP1Q9NZI7 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
UBP1Q9NZI7 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
UBP1Q9NZI7 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
UBP1Q9NZI7 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
UBP1Q9NZI7 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
UBP1Q9NZI7 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
UBP1Q9NZI7 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
UBP1Q9NZI7 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
UBP1Q9NZI7 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
UBP1Q9NZI7 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
UBP1Q9NZI7 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
UBP1Q9NZI7 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
UBP1Q9NZI7 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
UBP1Q9NZI7 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
UBP1Q9NZI7 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
UBP1Q9NZI7 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
UBP1Q9NZI7 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
UBP1Q9NZI7 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
UBP1Q9NZI7 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
UBP1Q9NZI7 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
UBP1Q9NZI7 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
UBP1Q9NZI7 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
UBP1Q9NZI7 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
UBP1Q9NZI7 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
UBP1Q9NZI7 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
UBP1Q9NZI7 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
UBP1Q9NZI7 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
UBP1Q9NZI7 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
UBP1Q9NZI7 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
UBP1Q9NZI7 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
UBP1Q9NZI7 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
UBP1Q9NZI7 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
UBP1Q9NZI7 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
UBP1Q9NZI7 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
UBP1Q9NZI7 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
UBP1Q9NZI7 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
UBP1Q9NZI7 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
UBP1Q9NZI7 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
UBP1Q9NZI7 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
UBP1Q9NZI7 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
UBP1Q9NZI7 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
UBP1Q9NZI7 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
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