Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYZ1

TVP23B, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TVP23BQ9NYZ1 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
TVP23BQ9NYZ1 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TVP23BQ9NYZ1 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TVP23BQ9NYZ1 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TVP23BQ9NYZ1 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TVP23BQ9NYZ1 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TVP23BQ9NYZ1 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TVP23BQ9NYZ1 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TVP23BQ9NYZ1 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TVP23BQ9NYZ1 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TVP23BQ9NYZ1 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TVP23BQ9NYZ1 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
TVP23BQ9NYZ1 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TVP23BQ9NYZ1 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TVP23BQ9NYZ1 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TVP23BQ9NYZ1 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TVP23BQ9NYZ1 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TVP23BQ9NYZ1 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TVP23BQ9NYZ1 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TVP23BQ9NYZ1 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
TVP23BQ9NYZ1 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TVP23BQ9NYZ1 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TVP23BQ9NYZ1 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TVP23BQ9NYZ1 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TVP23BQ9NYZ1 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TVP23BQ9NYZ1 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TVP23BQ9NYZ1 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TVP23BQ9NYZ1 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TVP23BQ9NYZ1 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TVP23BQ9NYZ1 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TVP23BQ9NYZ1 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TVP23BQ9NYZ1 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TVP23BQ9NYZ1 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TVP23BQ9NYZ1 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TVP23BQ9NYZ1 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TVP23BQ9NYZ1 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TVP23BQ9NYZ1 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TVP23BQ9NYZ1 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TVP23BQ9NYZ1 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TVP23BQ9NYZ1 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TVP23BQ9NYZ1 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TVP23BQ9NYZ1 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TVP23BQ9NYZ1 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TVP23BQ9NYZ1 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TVP23BQ9NYZ1 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TVP23BQ9NYZ1 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TVP23BQ9NYZ1 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TVP23BQ9NYZ1 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TVP23BQ9NYZ1 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TVP23BQ9NYZ1 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
TVP23BQ9NYZ1 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
TVP23BQ9NYZ1 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TVP23BQ9NYZ1 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
TVP23BQ9NYZ1 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
TVP23BQ9NYZ1 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TVP23BQ9NYZ1 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TVP23BQ9NYZ1 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TVP23BQ9NYZ1 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TVP23BQ9NYZ1 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TVP23BQ9NYZ1 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TVP23BQ9NYZ1 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TVP23BQ9NYZ1 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TVP23BQ9NYZ1 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TVP23BQ9NYZ1 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TVP23BQ9NYZ1 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TVP23BQ9NYZ1 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TVP23BQ9NYZ1 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TVP23BQ9NYZ1 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TVP23BQ9NYZ1 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TVP23BQ9NYZ1 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TVP23BQ9NYZ1 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TVP23BQ9NYZ1 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TVP23BQ9NYZ1 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TVP23BQ9NYZ1 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TVP23BQ9NYZ1 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TVP23BQ9NYZ1 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TVP23BQ9NYZ1 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TVP23BQ9NYZ1 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TVP23BQ9NYZ1 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TVP23BQ9NYZ1 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TVP23BQ9NYZ1 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TVP23BQ9NYZ1 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TVP23BQ9NYZ1 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TVP23BQ9NYZ1 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TVP23BQ9NYZ1 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TVP23BQ9NYZ1 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TVP23BQ9NYZ1 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TVP23BQ9NYZ1 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TVP23BQ9NYZ1 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TVP23BQ9NYZ1 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TVP23BQ9NYZ1 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TVP23BQ9NYZ1 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TVP23BQ9NYZ1 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TVP23BQ9NYZ1 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TVP23BQ9NYZ1 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TVP23BQ9NYZ1 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TVP23BQ9NYZ1 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TVP23BQ9NYZ1 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TVP23BQ9NYZ1 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TVP23BQ9NYZ1 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms