Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY91

SLC5A4, Solute carrier family 5 member 4, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A4Q9NY91 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC5A4Q9NY91 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC5A4Q9NY91 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC5A4Q9NY91 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC5A4Q9NY91 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC5A4Q9NY91 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC5A4Q9NY91 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC5A4Q9NY91 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC5A4Q9NY91 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC5A4Q9NY91 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC5A4Q9NY91 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC5A4Q9NY91 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC5A4Q9NY91 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC5A4Q9NY91 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC5A4Q9NY91 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC5A4Q9NY91 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC5A4Q9NY91 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC5A4Q9NY91 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC5A4Q9NY91 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC5A4Q9NY91 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC5A4Q9NY91 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC5A4Q9NY91 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC5A4Q9NY91 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC5A4Q9NY91 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC5A4Q9NY91 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC5A4Q9NY91 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC5A4Q9NY91 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC5A4Q9NY91 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC5A4Q9NY91 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC5A4Q9NY91 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC5A4Q9NY91 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC5A4Q9NY91 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC5A4Q9NY91 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC5A4Q9NY91 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC5A4Q9NY91 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC5A4Q9NY91 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC5A4Q9NY91 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC5A4Q9NY91 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC5A4Q9NY91 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC5A4Q9NY91 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC5A4Q9NY91 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC5A4Q9NY91 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC5A4Q9NY91 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC5A4Q9NY91 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC5A4Q9NY91 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC5A4Q9NY91 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC5A4Q9NY91 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC5A4Q9NY91 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC5A4Q9NY91 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC5A4Q9NY91 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC5A4Q9NY91 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC5A4Q9NY91 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC5A4Q9NY91 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC5A4Q9NY91 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC5A4Q9NY91 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC5A4Q9NY91 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC5A4Q9NY91 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC5A4Q9NY91 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SLC5A4Q9NY91 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SLC5A4Q9NY91 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SLC5A4Q9NY91 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SLC5A4Q9NY91 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
SLC5A4Q9NY91 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SLC5A4Q9NY91 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC5A4Q9NY91 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC5A4Q9NY91 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC5A4Q9NY91 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC5A4Q9NY91 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC5A4Q9NY91 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC5A4Q9NY91 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC5A4Q9NY91 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC5A4Q9NY91 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC5A4Q9NY91 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC5A4Q9NY91 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC5A4Q9NY91 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC5A4Q9NY91 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC5A4Q9NY91 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC5A4Q9NY91 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC5A4Q9NY91 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC5A4Q9NY91 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC5A4Q9NY91 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC5A4Q9NY91 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC5A4Q9NY91 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC5A4Q9NY91 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC5A4Q9NY91 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC5A4Q9NY91 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC5A4Q9NY91 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC5A4Q9NY91 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC5A4Q9NY91 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC5A4Q9NY91 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC5A4Q9NY91 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC5A4Q9NY91 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC5A4Q9NY91 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC5A4Q9NY91 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC5A4Q9NY91 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC5A4Q9NY91 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC5A4Q9NY91 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC5A4Q9NY91 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC5A4Q9NY91 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC5A4Q9NY91 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms