Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY59

SMPD3, Sphingomyelin phosphodiesterase 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPD3Q9NY59 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SMPD3Q9NY59 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SMPD3Q9NY59 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SMPD3Q9NY59 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SMPD3Q9NY59 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SMPD3Q9NY59 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
SMPD3Q9NY59 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SMPD3Q9NY59 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SMPD3Q9NY59 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SMPD3Q9NY59 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SMPD3Q9NY59 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SMPD3Q9NY59 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SMPD3Q9NY59 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SMPD3Q9NY59 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SMPD3Q9NY59 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SMPD3Q9NY59 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SMPD3Q9NY59 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SMPD3Q9NY59 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SMPD3Q9NY59 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SMPD3Q9NY59 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SMPD3Q9NY59 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
SMPD3Q9NY59 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SMPD3Q9NY59 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SMPD3Q9NY59 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SMPD3Q9NY59 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SMPD3Q9NY59 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SMPD3Q9NY59 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SMPD3Q9NY59 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SMPD3Q9NY59 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SMPD3Q9NY59 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SMPD3Q9NY59 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
SMPD3Q9NY59 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SMPD3Q9NY59 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SMPD3Q9NY59 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SMPD3Q9NY59 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SMPD3Q9NY59 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SMPD3Q9NY59 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SMPD3Q9NY59 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SMPD3Q9NY59 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SMPD3Q9NY59 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SMPD3Q9NY59 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SMPD3Q9NY59 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SMPD3Q9NY59 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
SMPD3Q9NY59 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SMPD3Q9NY59 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SMPD3Q9NY59 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SMPD3Q9NY59 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SMPD3Q9NY59 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SMPD3Q9NY59 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
SMPD3Q9NY59 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SMPD3Q9NY59 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SMPD3Q9NY59 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SMPD3Q9NY59 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SMPD3Q9NY59 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
SMPD3Q9NY59 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SMPD3Q9NY59 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SMPD3Q9NY59 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SMPD3Q9NY59 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SMPD3Q9NY59 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SMPD3Q9NY59 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SMPD3Q9NY59 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SMPD3Q9NY59 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SMPD3Q9NY59 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SMPD3Q9NY59 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SMPD3Q9NY59 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SMPD3Q9NY59 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SMPD3Q9NY59 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SMPD3Q9NY59 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SMPD3Q9NY59 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
SMPD3Q9NY59 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SMPD3Q9NY59 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SMPD3Q9NY59 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SMPD3Q9NY59 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SMPD3Q9NY59 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SMPD3Q9NY59 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SMPD3Q9NY59 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SMPD3Q9NY59 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SMPD3Q9NY59 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SMPD3Q9NY59 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SMPD3Q9NY59 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SMPD3Q9NY59 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SMPD3Q9NY59 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SMPD3Q9NY59 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SMPD3Q9NY59 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SMPD3Q9NY59 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
SMPD3Q9NY59 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
SMPD3Q9NY59 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
SMPD3Q9NY59 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
SMPD3Q9NY59 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SMPD3Q9NY59 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SMPD3Q9NY59 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SMPD3Q9NY59 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SMPD3Q9NY59 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SMPD3Q9NY59 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SMPD3Q9NY59 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SMPD3Q9NY59 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SMPD3Q9NY59 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SMPD3Q9NY59 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SMPD3Q9NY59 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SMPD3Q9NY59 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms