Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXZ2

DDX43, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX43Q9NXZ2 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DDX43Q9NXZ2 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DDX43Q9NXZ2 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DDX43Q9NXZ2 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
DDX43Q9NXZ2 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
DDX43Q9NXZ2 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DDX43Q9NXZ2 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DDX43Q9NXZ2 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DDX43Q9NXZ2 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DDX43Q9NXZ2 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DDX43Q9NXZ2 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DDX43Q9NXZ2 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DDX43Q9NXZ2 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DDX43Q9NXZ2 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DDX43Q9NXZ2 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DDX43Q9NXZ2 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
DDX43Q9NXZ2 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DDX43Q9NXZ2 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DDX43Q9NXZ2 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DDX43Q9NXZ2 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DDX43Q9NXZ2 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DDX43Q9NXZ2 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DDX43Q9NXZ2 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DDX43Q9NXZ2 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DDX43Q9NXZ2 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DDX43Q9NXZ2 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DDX43Q9NXZ2 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DDX43Q9NXZ2 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DDX43Q9NXZ2 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DDX43Q9NXZ2 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DDX43Q9NXZ2 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
DDX43Q9NXZ2 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
DDX43Q9NXZ2 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
DDX43Q9NXZ2 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DDX43Q9NXZ2 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
DDX43Q9NXZ2 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
DDX43Q9NXZ2 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DDX43Q9NXZ2 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DDX43Q9NXZ2 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DDX43Q9NXZ2 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DDX43Q9NXZ2 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DDX43Q9NXZ2 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DDX43Q9NXZ2 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DDX43Q9NXZ2 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DDX43Q9NXZ2 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DDX43Q9NXZ2 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DDX43Q9NXZ2 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
DDX43Q9NXZ2 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DDX43Q9NXZ2 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DDX43Q9NXZ2 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DDX43Q9NXZ2 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DDX43Q9NXZ2 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DDX43Q9NXZ2 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DDX43Q9NXZ2 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DDX43Q9NXZ2 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DDX43Q9NXZ2 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DDX43Q9NXZ2 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
DDX43Q9NXZ2 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DDX43Q9NXZ2 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DDX43Q9NXZ2 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DDX43Q9NXZ2 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DDX43Q9NXZ2 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DDX43Q9NXZ2 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DDX43Q9NXZ2 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DDX43Q9NXZ2 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DDX43Q9NXZ2 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DDX43Q9NXZ2 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DDX43Q9NXZ2 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
DDX43Q9NXZ2 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DDX43Q9NXZ2 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DDX43Q9NXZ2 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DDX43Q9NXZ2 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DDX43Q9NXZ2 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DDX43Q9NXZ2 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DDX43Q9NXZ2 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DDX43Q9NXZ2 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DDX43Q9NXZ2 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DDX43Q9NXZ2 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
DDX43Q9NXZ2 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
DDX43Q9NXZ2 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DDX43Q9NXZ2 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DDX43Q9NXZ2 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DDX43Q9NXZ2 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DDX43Q9NXZ2 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DDX43Q9NXZ2 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DDX43Q9NXZ2 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DDX43Q9NXZ2 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DDX43Q9NXZ2 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DDX43Q9NXZ2 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DDX43Q9NXZ2 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DDX43Q9NXZ2 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DDX43Q9NXZ2 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DDX43Q9NXZ2 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DDX43Q9NXZ2 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DDX43Q9NXZ2 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DDX43Q9NXZ2 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DDX43Q9NXZ2 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DDX43Q9NXZ2 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DDX43Q9NXZ2 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DDX43Q9NXZ2 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms