Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXW9

ALKBH4, Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase alkB homolog 4, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALKBH4Q9NXW9 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ALKBH4Q9NXW9 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ALKBH4Q9NXW9 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ALKBH4Q9NXW9 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ALKBH4Q9NXW9 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ALKBH4Q9NXW9 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ALKBH4Q9NXW9 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ALKBH4Q9NXW9 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ALKBH4Q9NXW9 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ALKBH4Q9NXW9 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ALKBH4Q9NXW9 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ALKBH4Q9NXW9 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ALKBH4Q9NXW9 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ALKBH4Q9NXW9 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
ALKBH4Q9NXW9 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ALKBH4Q9NXW9 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ALKBH4Q9NXW9 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ALKBH4Q9NXW9 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
ALKBH4Q9NXW9 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
ALKBH4Q9NXW9 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
ALKBH4Q9NXW9 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ALKBH4Q9NXW9 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ALKBH4Q9NXW9 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ALKBH4Q9NXW9 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ALKBH4Q9NXW9 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ALKBH4Q9NXW9 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ALKBH4Q9NXW9 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ALKBH4Q9NXW9 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ALKBH4Q9NXW9 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ALKBH4Q9NXW9 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ALKBH4Q9NXW9 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ALKBH4Q9NXW9 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ALKBH4Q9NXW9 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ALKBH4Q9NXW9 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ALKBH4Q9NXW9 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ALKBH4Q9NXW9 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ALKBH4Q9NXW9 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ALKBH4Q9NXW9 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ALKBH4Q9NXW9 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ALKBH4Q9NXW9 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ALKBH4Q9NXW9 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ALKBH4Q9NXW9 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ALKBH4Q9NXW9 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ALKBH4Q9NXW9 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ALKBH4Q9NXW9 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
ALKBH4Q9NXW9 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ALKBH4Q9NXW9 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ALKBH4Q9NXW9 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ALKBH4Q9NXW9 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ALKBH4Q9NXW9 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ALKBH4Q9NXW9 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ALKBH4Q9NXW9 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ALKBH4Q9NXW9 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ALKBH4Q9NXW9 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ALKBH4Q9NXW9 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ALKBH4Q9NXW9 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ALKBH4Q9NXW9 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ALKBH4Q9NXW9 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ALKBH4Q9NXW9 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ALKBH4Q9NXW9 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
ALKBH4Q9NXW9 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ALKBH4Q9NXW9 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ALKBH4Q9NXW9 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC19■□□□□ 0.63
ALKBH4Q9NXW9 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ALKBH4Q9NXW9 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ALKBH4Q9NXW9 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ALKBH4Q9NXW9 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ALKBH4Q9NXW9 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ALKBH4Q9NXW9 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ALKBH4Q9NXW9 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ALKBH4Q9NXW9 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ALKBH4Q9NXW9 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ALKBH4Q9NXW9 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ALKBH4Q9NXW9 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ALKBH4Q9NXW9 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ALKBH4Q9NXW9 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ALKBH4Q9NXW9 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ALKBH4Q9NXW9 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ALKBH4Q9NXW9 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ALKBH4Q9NXW9 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ALKBH4Q9NXW9 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ALKBH4Q9NXW9 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ALKBH4Q9NXW9 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ALKBH4Q9NXW9 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ALKBH4Q9NXW9 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ALKBH4Q9NXW9 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ALKBH4Q9NXW9 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ALKBH4Q9NXW9 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ALKBH4Q9NXW9 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ALKBH4Q9NXW9 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ALKBH4Q9NXW9 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ALKBH4Q9NXW9 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ALKBH4Q9NXW9 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ALKBH4Q9NXW9 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ALKBH4Q9NXW9 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ALKBH4Q9NXW9 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ALKBH4Q9NXW9 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ALKBH4Q9NXW9 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ALKBH4Q9NXW9 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ALKBH4Q9NXW9 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms