Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXN4

GDAP2, Ganglioside-induced differentiation-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDAP2Q9NXN4 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GDAP2Q9NXN4 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GDAP2Q9NXN4 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GDAP2Q9NXN4 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GDAP2Q9NXN4 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GDAP2Q9NXN4 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GDAP2Q9NXN4 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GDAP2Q9NXN4 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GDAP2Q9NXN4 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GDAP2Q9NXN4 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GDAP2Q9NXN4 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GDAP2Q9NXN4 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GDAP2Q9NXN4 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GDAP2Q9NXN4 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GDAP2Q9NXN4 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
GDAP2Q9NXN4 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GDAP2Q9NXN4 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GDAP2Q9NXN4 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GDAP2Q9NXN4 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GDAP2Q9NXN4 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GDAP2Q9NXN4 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GDAP2Q9NXN4 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
GDAP2Q9NXN4 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GDAP2Q9NXN4 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GDAP2Q9NXN4 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GDAP2Q9NXN4 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
GDAP2Q9NXN4 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GDAP2Q9NXN4 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GDAP2Q9NXN4 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GDAP2Q9NXN4 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
GDAP2Q9NXN4 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
GDAP2Q9NXN4 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GDAP2Q9NXN4 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GDAP2Q9NXN4 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GDAP2Q9NXN4 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GDAP2Q9NXN4 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GDAP2Q9NXN4 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GDAP2Q9NXN4 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GDAP2Q9NXN4 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GDAP2Q9NXN4 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GDAP2Q9NXN4 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GDAP2Q9NXN4 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GDAP2Q9NXN4 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GDAP2Q9NXN4 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GDAP2Q9NXN4 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GDAP2Q9NXN4 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GDAP2Q9NXN4 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GDAP2Q9NXN4 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GDAP2Q9NXN4 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GDAP2Q9NXN4 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GDAP2Q9NXN4 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
GDAP2Q9NXN4 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GDAP2Q9NXN4 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GDAP2Q9NXN4 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GDAP2Q9NXN4 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GDAP2Q9NXN4 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GDAP2Q9NXN4 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GDAP2Q9NXN4 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
GDAP2Q9NXN4 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
GDAP2Q9NXN4 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GDAP2Q9NXN4 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GDAP2Q9NXN4 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GDAP2Q9NXN4 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GDAP2Q9NXN4 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GDAP2Q9NXN4 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
GDAP2Q9NXN4 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GDAP2Q9NXN4 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GDAP2Q9NXN4 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
GDAP2Q9NXN4 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GDAP2Q9NXN4 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GDAP2Q9NXN4 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GDAP2Q9NXN4 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GDAP2Q9NXN4 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GDAP2Q9NXN4 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
GDAP2Q9NXN4 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
GDAP2Q9NXN4 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GDAP2Q9NXN4 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GDAP2Q9NXN4 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GDAP2Q9NXN4 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GDAP2Q9NXN4 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GDAP2Q9NXN4 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
GDAP2Q9NXN4 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GDAP2Q9NXN4 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GDAP2Q9NXN4 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GDAP2Q9NXN4 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GDAP2Q9NXN4 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GDAP2Q9NXN4 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GDAP2Q9NXN4 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GDAP2Q9NXN4 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
GDAP2Q9NXN4 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GDAP2Q9NXN4 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GDAP2Q9NXN4 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GDAP2Q9NXN4 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GDAP2Q9NXN4 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GDAP2Q9NXN4 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GDAP2Q9NXN4 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GDAP2Q9NXN4 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GDAP2Q9NXN4 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GDAP2Q9NXN4 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GDAP2Q9NXN4 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms