Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX36

DNAJC28, DnaJ homolog subfamily C member 28, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC28Q9NX36 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DNAJC28Q9NX36 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DNAJC28Q9NX36 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
DNAJC28Q9NX36 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DNAJC28Q9NX36 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DNAJC28Q9NX36 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DNAJC28Q9NX36 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DNAJC28Q9NX36 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DNAJC28Q9NX36 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DNAJC28Q9NX36 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DNAJC28Q9NX36 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DNAJC28Q9NX36 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DNAJC28Q9NX36 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
DNAJC28Q9NX36 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DNAJC28Q9NX36 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DNAJC28Q9NX36 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DNAJC28Q9NX36 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DNAJC28Q9NX36 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DNAJC28Q9NX36 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DNAJC28Q9NX36 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DNAJC28Q9NX36 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DNAJC28Q9NX36 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DNAJC28Q9NX36 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DNAJC28Q9NX36 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
DNAJC28Q9NX36 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DNAJC28Q9NX36 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DNAJC28Q9NX36 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DNAJC28Q9NX36 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DNAJC28Q9NX36 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DNAJC28Q9NX36 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
DNAJC28Q9NX36 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DNAJC28Q9NX36 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
DNAJC28Q9NX36 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
DNAJC28Q9NX36 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
DNAJC28Q9NX36 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
DNAJC28Q9NX36 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
DNAJC28Q9NX36 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
DNAJC28Q9NX36 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DNAJC28Q9NX36 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DNAJC28Q9NX36 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
DNAJC28Q9NX36 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DNAJC28Q9NX36 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DNAJC28Q9NX36 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
DNAJC28Q9NX36 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DNAJC28Q9NX36 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
DNAJC28Q9NX36 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DNAJC28Q9NX36 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
DNAJC28Q9NX36 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
DNAJC28Q9NX36 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DNAJC28Q9NX36 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DNAJC28Q9NX36 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DNAJC28Q9NX36 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
DNAJC28Q9NX36 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DNAJC28Q9NX36 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
DNAJC28Q9NX36 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
DNAJC28Q9NX36 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
DNAJC28Q9NX36 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
DNAJC28Q9NX36 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
DNAJC28Q9NX36 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
DNAJC28Q9NX36 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
DNAJC28Q9NX36 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
DNAJC28Q9NX36 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
DNAJC28Q9NX36 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
DNAJC28Q9NX36 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
DNAJC28Q9NX36 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
DNAJC28Q9NX36 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
DNAJC28Q9NX36 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
DNAJC28Q9NX36 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
DNAJC28Q9NX36 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
DNAJC28Q9NX36 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
DNAJC28Q9NX36 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
DNAJC28Q9NX36 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
DNAJC28Q9NX36 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
DNAJC28Q9NX36 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
DNAJC28Q9NX36 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
DNAJC28Q9NX36 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
DNAJC28Q9NX36 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
DNAJC28Q9NX36 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
DNAJC28Q9NX36 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
DNAJC28Q9NX36 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
DNAJC28Q9NX36 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
DNAJC28Q9NX36 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
DNAJC28Q9NX36 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
DNAJC28Q9NX36 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
DNAJC28Q9NX36 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
DNAJC28Q9NX36 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
DNAJC28Q9NX36 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
DNAJC28Q9NX36 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
DNAJC28Q9NX36 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
DNAJC28Q9NX36 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
DNAJC28Q9NX36 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
DNAJC28Q9NX36 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
DNAJC28Q9NX36 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
DNAJC28Q9NX36 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
DNAJC28Q9NX36 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
DNAJC28Q9NX36 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
DNAJC28Q9NX36 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
DNAJC28Q9NX36 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
DNAJC28Q9NX36 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
DNAJC28Q9NX36 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms