Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVC3

SLC38A7, Putative sodium-coupled neutral amino acid transporter 7, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A7Q9NVC3 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC38A7Q9NVC3 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC38A7Q9NVC3 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC38A7Q9NVC3 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC38A7Q9NVC3 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC38A7Q9NVC3 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC38A7Q9NVC3 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC38A7Q9NVC3 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC38A7Q9NVC3 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC38A7Q9NVC3 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC38A7Q9NVC3 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC38A7Q9NVC3 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC38A7Q9NVC3 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC38A7Q9NVC3 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC38A7Q9NVC3 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC38A7Q9NVC3 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC38A7Q9NVC3 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC38A7Q9NVC3 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC38A7Q9NVC3 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC38A7Q9NVC3 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC38A7Q9NVC3 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC38A7Q9NVC3 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC38A7Q9NVC3 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC38A7Q9NVC3 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC38A7Q9NVC3 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC38A7Q9NVC3 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC38A7Q9NVC3 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC38A7Q9NVC3 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC38A7Q9NVC3 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC38A7Q9NVC3 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC38A7Q9NVC3 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC38A7Q9NVC3 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC38A7Q9NVC3 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC38A7Q9NVC3 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC38A7Q9NVC3 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC38A7Q9NVC3 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC38A7Q9NVC3 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC38A7Q9NVC3 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC38A7Q9NVC3 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC38A7Q9NVC3 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC38A7Q9NVC3 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC38A7Q9NVC3 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC38A7Q9NVC3 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC38A7Q9NVC3 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC38A7Q9NVC3 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC38A7Q9NVC3 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC38A7Q9NVC3 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC38A7Q9NVC3 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC38A7Q9NVC3 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC38A7Q9NVC3 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC38A7Q9NVC3 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC38A7Q9NVC3 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC38A7Q9NVC3 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC38A7Q9NVC3 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC38A7Q9NVC3 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC38A7Q9NVC3 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC38A7Q9NVC3 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC38A7Q9NVC3 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC38A7Q9NVC3 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC38A7Q9NVC3 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC38A7Q9NVC3 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC38A7Q9NVC3 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC38A7Q9NVC3 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC38A7Q9NVC3 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC38A7Q9NVC3 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC38A7Q9NVC3 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC38A7Q9NVC3 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC38A7Q9NVC3 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC38A7Q9NVC3 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC38A7Q9NVC3 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC38A7Q9NVC3 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC38A7Q9NVC3 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC38A7Q9NVC3 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC38A7Q9NVC3 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC38A7Q9NVC3 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC38A7Q9NVC3 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC38A7Q9NVC3 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC38A7Q9NVC3 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC38A7Q9NVC3 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC38A7Q9NVC3 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC38A7Q9NVC3 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC38A7Q9NVC3 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC38A7Q9NVC3 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC38A7Q9NVC3 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC38A7Q9NVC3 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC38A7Q9NVC3 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC38A7Q9NVC3 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC38A7Q9NVC3 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC38A7Q9NVC3 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC38A7Q9NVC3 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC38A7Q9NVC3 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC38A7Q9NVC3 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC38A7Q9NVC3 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC38A7Q9NVC3 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC38A7Q9NVC3 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC38A7Q9NVC3 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC38A7Q9NVC3 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC38A7Q9NVC3 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC38A7Q9NVC3 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC38A7Q9NVC3 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms