Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTQ9

GJB4, Gap junction beta-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB4Q9NTQ9 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GJB4Q9NTQ9 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GJB4Q9NTQ9 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GJB4Q9NTQ9 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GJB4Q9NTQ9 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GJB4Q9NTQ9 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GJB4Q9NTQ9 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GJB4Q9NTQ9 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GJB4Q9NTQ9 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GJB4Q9NTQ9 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GJB4Q9NTQ9 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GJB4Q9NTQ9 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GJB4Q9NTQ9 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GJB4Q9NTQ9 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GJB4Q9NTQ9 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GJB4Q9NTQ9 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
GJB4Q9NTQ9 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GJB4Q9NTQ9 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GJB4Q9NTQ9 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GJB4Q9NTQ9 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GJB4Q9NTQ9 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GJB4Q9NTQ9 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GJB4Q9NTQ9 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GJB4Q9NTQ9 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GJB4Q9NTQ9 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GJB4Q9NTQ9 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GJB4Q9NTQ9 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GJB4Q9NTQ9 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GJB4Q9NTQ9 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GJB4Q9NTQ9 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GJB4Q9NTQ9 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GJB4Q9NTQ9 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GJB4Q9NTQ9 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GJB4Q9NTQ9 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GJB4Q9NTQ9 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GJB4Q9NTQ9 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
GJB4Q9NTQ9 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GJB4Q9NTQ9 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GJB4Q9NTQ9 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GJB4Q9NTQ9 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GJB4Q9NTQ9 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GJB4Q9NTQ9 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GJB4Q9NTQ9 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GJB4Q9NTQ9 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GJB4Q9NTQ9 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GJB4Q9NTQ9 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GJB4Q9NTQ9 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GJB4Q9NTQ9 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GJB4Q9NTQ9 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
GJB4Q9NTQ9 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
GJB4Q9NTQ9 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24■■□□□ 1.43
GJB4Q9NTQ9 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24■■□□□ 1.43
GJB4Q9NTQ9 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
GJB4Q9NTQ9 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
GJB4Q9NTQ9 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
GJB4Q9NTQ9 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
GJB4Q9NTQ9 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
GJB4Q9NTQ9 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
GJB4Q9NTQ9 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24■■□□□ 1.43
GJB4Q9NTQ9 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GJB4Q9NTQ9 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GJB4Q9NTQ9 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GJB4Q9NTQ9 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
GJB4Q9NTQ9 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GJB4Q9NTQ9 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GJB4Q9NTQ9 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GJB4Q9NTQ9 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GJB4Q9NTQ9 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GJB4Q9NTQ9 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GJB4Q9NTQ9 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GJB4Q9NTQ9 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GJB4Q9NTQ9 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GJB4Q9NTQ9 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GJB4Q9NTQ9 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GJB4Q9NTQ9 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GJB4Q9NTQ9 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GJB4Q9NTQ9 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GJB4Q9NTQ9 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GJB4Q9NTQ9 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GJB4Q9NTQ9 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GJB4Q9NTQ9 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
GJB4Q9NTQ9 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GJB4Q9NTQ9 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GJB4Q9NTQ9 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
GJB4Q9NTQ9 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GJB4Q9NTQ9 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GJB4Q9NTQ9 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GJB4Q9NTQ9 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GJB4Q9NTQ9 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GJB4Q9NTQ9 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
GJB4Q9NTQ9 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GJB4Q9NTQ9 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GJB4Q9NTQ9 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GJB4Q9NTQ9 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GJB4Q9NTQ9 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GJB4Q9NTQ9 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GJB4Q9NTQ9 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GJB4Q9NTQ9 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GJB4Q9NTQ9 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GJB4Q9NTQ9 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms